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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003152`

染色体: Chr03 坐标: 48879391-48880158 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003152`
名称	SmilChr03G003152
描述	uncharacterized SmilChr03G003152
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48879391 - 48880158 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018928`
GeneID	`131018928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018928`
原始查询	`SmilChr03G003152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=24.2; qcov=0.941; evalue=2.26e-09; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.9; qcov=0.773; evalue=3.22e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803596.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803596.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803596.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803596.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48879397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C9
`Chr3:48879412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B55,C67
`Chr3:48879419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C49
`Chr3:48879430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B63
`Chr3:48879449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B130,C2,C39,C78
`Chr3:48879472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A18,A24,B105,B127,B130,B18,B25,B3,B30,B37,B5,B6,B69,B70,B72,B82,C10,C21,C47,C67,C77,C82,C87,D8,D9
`Chr3:48879478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B45,B52,B64,C10,C38,C43,C72,C74,C82,D9
`Chr3:48879481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B30,D9
`Chr3:48879519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:48879520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A18,A23,A3,B107,B109,B121,B139,B20,B22,B23,B3,B30,B33,B36,B5,B62,C1,C17,C43,C5,C65,C7,C75,C76,C77,C87
`Chr3:48879534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C78
`Chr3:48879541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B69,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803596.1

255 aa

128

255

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803596.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	151	1.7e-17	64.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947613.1
ATGGGGGAATGGATTGATGAGAGTTGGATGTGGTCTCTCAATTGGCGAAGGGTGCTTCTTGACAGGGAGGTCGAGCAAACTCAATCTCTACTTGGTCAGTTATCTGGTTTCTCTCCTTGTGTAGGTTCAGTGGATAAATGGTTTTGGAGAGCCCAAAAGAATGGAGTTTACACTGCAAACTCGGCCTATCAAGCAATTAGAGACCAAATTGAGGAAAGAAGAGTTGAGCCGGAAGAGATGAATCTTTTCAGTGATTTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018928
ATGGGGGAATGGATTGATGAGAGTTGGATGTGGTCTCTCAATTGGCGAAGGGTGCTTCTTGACAGGGAGGTCGAGCAAACTCAATCTCTACTTGGTCAGTTATCTGGTTTCTCTCCTTGTGTAGGTTCAGTGGATAAATGGTTTTGGAGAGCCCAAAAGAATGGAGTTTACACTGCAAACTCGGCCTATCAAGCAATTAGAGACCAAATTGAGGAAAGAAGAGTTGAGCCGGAAGAGATGAATCTTTTCAGTGATTTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803596.1
MGEWIDESWMWSLNWRRVLLDREVEQTQSLLGQLSGFSPCVGSVDKWFWRAQKNGVYTANSAYQAIRDQIEERRVEPEEMNLFSDLWNSTAPQKVRVTTWRVLRNRLPTCDNLIRRNIQVGEVEKSCVACFFPQESAIHLFLDCPKSAMIWDQILNWTGYSWARPRGIPEHFSSFVYLANGKNSTQLLKALWMCTIWVIWRKRNESRFEDKVWELKSIIMEIKTRMWSWNKIFGFFAWEPPILEWCSSQLYSFML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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