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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003173`

染色体: Chr03 坐标: 49111047-49116754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003173`
名称	SmilChr03G003173
描述	sulfate transporter 3.1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49111047 - 49116754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016312`
GeneID	`131016312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016312`
原始查询	`SmilChr03G003173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfate transporter 3.1-like
产物	sulfate transporter 3.1-like
Arabidopsis	`AT3G51895` (SULTR3;1) sulfate transporter 3;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824353] identity=74.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0161200` (OsSultr3) - identity=69.7; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008271 (secondary active sulfate transmembrane transporter activity); GO:0008272 (GO:0008272); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00916 (Sulfate_transp); PF01740 (STAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800973.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800973.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800973.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800973.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800973.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49111490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:49111687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:49112067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:49112096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:49112217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:49112295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:49112452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B34,B61,B86,C36
`Chr3:49113648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B68,D9
`Chr3:49116527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:49116617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:49116648`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A11,A19,B111,B121,B17,B56,B58,B64,B84,B96,C53,C57,C80,C84,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800973.1

650 aa

325

650

Sulfate_transp

STAS

PF00916 Sulfate_transp 77-457 aa PF01740 STAS 512-627 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800973.1`	Pfam	`PF00916`	Sulfate_transp	Family	77	457	1.1e-141	472.8	Sulfate permease family
`XP_057800973.1`	Pfam	`PF01740`	STAS	Domain	512	627	3.8e-27	94.9	STAS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944990.1
TTTCTCACTCAAACCCACACACTTAAGGAAGAGAAACACTTGAACATTTCTCCTAAGCCAAAAACACAAACGTATAGTATGGGCAGCGGCGATCACGTGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCAGCGCGTGGAGATCCCGCCTCCGCAGCCGTTCTCGAAATCTCTAAAGAACACTCTGAAGGAGACATTCTTCCCGGACGACCCCCTCCGGCAGTTCAAGAACCAGCCCCCGCGGCGGCGGCTCCTCCTCGGCCTGCAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016312
ATGGGCAGCGGCGATCACGTGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCAGCGCGTGGAGATCCCGCCTCCGCAGCCGTTCTCGAAATCTCTAAAGAACACTCTGAAGGAGACATTCTTCCCGGACGACCCCCTCCGGCAGTTCAAGAACCAGCCCCCGCGGCGGCGGCTCCTCCTCGGCCTGCAGTACGTGTTTCCCATCCTCGAGTGGGGCCGCCATTACACTCTCGAGTTCTTCAAGGCCGACCTCATCGCCGGAATCACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800973.1
MGSGDHVGGGGGGGQRVEIPPPQPFSKSLKNTLKETFFPDDPLRQFKNQPPRRRLLLGLQYVFPILEWGRHYTLEFFKADLIAGITIASLAIPQGISYAKLANLPPILGLYSSFVPPLIYAVMGSSRDLAVGTVAVASLLTASMLGGVVDPQQDPQLYLHLAFTATFFAGLFETAMGIFRLGFIVDFLSHATIVGFMAGAATVVILQQLKGVLGLEHFTHKTDVIDVLHSIFTQTHQWRWESALLGFVFLFYLLISRYFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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