当前解析结果
SmilChr03G003176| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003176 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003176 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003176 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 49207948 - 49209555 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016339 |
|---|---|
| GeneID | 131016339 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016339 |
| 原始查询 | SmilChr03G003176 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0590366- identity=27.9; qcov=0.871; evalue=3.57e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016339 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801014.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057801016.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801014.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801014.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801014.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:49208205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B4 |
Chr3:49208266 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B35,B55,C23 |
Chr3:49208278 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr3:49208336 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr3:49208343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B140,B90,B92,C87 |
Chr3:49208355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr3:49208377 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr3:49208413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr3:49208428 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr3:49208480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B63,B83 |
Chr3:49208591 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C31 |
Chr3:49208603 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。