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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003184`

染色体: Chr03 坐标: 49291943-49294589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003184`
名称	SmilChr03G003184
描述	probable protein phosphatase 2C 51
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49291943 - 49294589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016327`
GeneID	`131016327`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016327`
原始查询	`SmilChr03G003184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 51
产物	probable protein phosphatase 2C 51
Arabidopsis	`AT3G63340` (AT3G63340) kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825509] identity=39; qcov=1.1; evalue=4.06e-85; confidence=medium
Rice	`Os11g0586100` (OsPP2C76) - identity=35.2; qcov=1.11; evalue=6.75e-72; confidence=medium
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016327

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057800995.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800995.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057800995.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057800995.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49292107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B68,D11
`Chr3:49292396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:49292494`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C58
`Chr3:49292494`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C58
`Chr3:49292818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:49292877`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A16,B125,B43,C31,C34,D1
`Chr3:49292882`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A16,B125,B43,C34,D1
`Chr3:49292882`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A16,B125,B43,C34,D1
`Chr3:49293198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800995.1

382 aa

191

382

PP2C

PF00481 PP2C 111-364 aa

XP_057800996.1

382 aa

191

382

PP2C

PF00481 PP2C 111-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800995.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	111	364	1.9e-44	152.9	Protein phosphatase 2C
`XP_057800996.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	111	364	1.9e-44	152.9	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945013.1
TGAATAAAATAGAATGCACCTTATCTTTCTAGTTCCTACTTTACAATTGAGCTTCTGATTTTCGTAAATGAAGAGTAATACAGAATAATTGAGAAATTCCTAAATTCTAACCGTATTGAATCAACGGATGTTAATTTGAAGAACCAATTCCATATTTAGAGGAAGAATGAGCATTGAATTAATTTTCATCACATAGTAATCAAGCTCGAGCGAGCTTTCATAGAGACGAACACGAACACGAACACGGGTCAAGCTACCAA...

XM_057945012.1
AAATAGAATGCACCTTATCTTTCTAGTTCCTACTTTACAATTGAGCTTCTGATTTTCGTAAATGAAGAGTAATACAGAATAATTGAGAAATTCCTAAATTCTAACCGTATTGAATCAACGGATGTTAATTTGAAGAACCAATTCCATATTTAGAGGAAGAATGAGCATTGAATTAATTTTCATCACATAGTAATCAAGCTCGAGCGAGCTTTCATAGAGACGAACACGAACACGAACACGGGTCAAGCTACCAAGCTTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016327
ATGTCGATGCATTTCATGATTAAATGGCTTGCAATATTTACATCGATTAGAGGTTTGTTATGCACGGTAGTAGCATATGCCAATCATGGGATCTCATTGTCCTGTATAATGGCATATGAAGAAGGTGGAGTTCGTGCTGTCTTAAACTCACCTGAGTGTCCTTGGCTGTTCTCTTCTGTTGAATCATCGAACTCGACCAAGAATTGCCAGTTTGCCATGCTACAAGGCCGTAGAGAATATCAAGAAGATCGCGTAGTGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800995.1
MSMHFMIKWLAIFTSIRGLLCTVVAYANHGISLSCIMAYEEGGVRAVLNSPECPWLFSSVESSNSTKNCQFAMLQGRREYQEDRVVCNLDLELPFSGDPGFFYPGEEVPVETSIGIAAIFDGHGGDEASEMASTMLSSYFLMNVVFGAYKRVLPSYEEYNKTQCRLRRMPAVIDRRSLRSDLEEALLRTIKDIDSEFSKQAVDKGYVSGSTGTIALLFEGQLLVANVGDSKALLCFTKGDSSKDVYVEELTRDHHPDRAD...

XP_057800996.1
MSMHFMIKWLAIFTSIRGLLCTVVAYANHGISLSCIMAYEEGGVRAVLNSPECPWLFSSVESSNSTKNCQFAMLQGRREYQEDRVVCNLDLELPFSGDPGFFYPGEEVPVETSIGIAAIFDGHGGDEASEMASTMLSSYFLMNVVFGAYKRVLPSYEEYNKTQCRLRRMPAVIDRRSLRSDLEEALLRTIKDIDSEFSKQAVDKGYVSGSTGTIALLFEGQLLVANVGDSKALLCFTKGDSSKDVYVEELTRDHHPDRAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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