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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003194`

染色体: Chr03 坐标: 49417942-49442263 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003194`
名称	SmilChr03G003194
描述	protein SPIRRIG-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49417942 - 49442263 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016304`
GeneID	`131016304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016304`
原始查询	`SmilChr03G003194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SPIRRIG-like
产物	protein SPIRRIG-like
Arabidopsis	`AT1G03060` (SPI) BEACH-DOMAIN HOMOLOG A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839323] identity=70.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0744675` - identity=60.5; qcov=0.276; evalue=0; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF02138 (Beach); PF14844 (PH_BEACH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057800950.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057800950.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800950.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800950.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057800950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49425073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B73
`Chr3:49425236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:49429206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:49429640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:49430060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D9
`Chr3:49431416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B19,B88,C45,C73
`Chr3:49431665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C45
`Chr3:49432182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B139
`Chr3:49432983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:49433112`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr3:49433112`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C34
`Chr3:49433401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800950.1

3610 aa

1805

3610

PH_BEACH

Beach

WD40

PF14844 PH_BEACH 2900-2954 aa PF02138 Beach 2993-3272 aa PF00400 WD40 3356-3385 aa PF00400 WD40 3402-3436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800950.1`	Pfam	`PF14844`	PH_BEACH	Domain	2900	2954	5.2e-08	33.7	PH domain associated with Beige/BEACH
`XP_057800950.1`	Pfam	`PF02138`	Beach	Family	2993	3272	3.7e-120	401.2	Beige/BEACH domain
`XP_057800950.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	3356	3385	8.4e-13	48.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057800950.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	3402	3436	8.4e-13	48.9	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944967.1
GAGAGAAAGAAACATGTTAGAGATACAGAGCGAGAAACAAGGCGCGGAGAGGCCGTCCGAAAACAAGAGAGAAAACACGCTGCATTTTCTTTTCTTCTTCTCTTTGCTCTAAACTTTTTCTTTTCAACTCCCAATTTCTAGGGCAAAATCTAAGATTCAACACCCTCTCGATAATCTATAAGAAAATTGTTTGACTGACATTTTCGATTGTCTCCTTCCCAACTCCGACATAGATTAATCCGGCATACACATAAAATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016304
ATGTTTGGAAATTCAAGTGGAAAGAAAACGATGAAATGGGTAACATTGCTTAAAGACTTCAAGGAAAAAGTTGGTCTTTCCCCGCCTCCGGCGTCGGCCCCAACAACTCCATCTCCACCACCCCCGAGAGATAGAATCAGCAGCAGCAGCAGCAATGCAAACGATTTGTCACCGACCAGCCCAGACTATTGGTCATTGCCTTCAAGCAGAGACAAAGATGAACTGGAATTGGATTTTAAGAGATGCTGGGAAGAGTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800950.1
MFGNSSGKKTMKWVTLLKDFKEKVGLSPPPASAPTTPSPPPPRDRISSSSSNANDLSPTSPDYWSLPSSRDKDELELDFKRCWEEFRSSNSEKEKERALTWTVEIFCRLEREHKNVAQLISILVETHIFSFVVGRAFVTDIDKLKLSSKTRALEAEKVLLFFSEITKDGITPGANLLHAVEVLVSGPVDKQSFLDSGIFCCLIHVLNALLAPDGGSHLKNSSHSEDLSTFDEKNDETRPARKLEVEGSVVHIMKALASHP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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