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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003208`

染色体: Chr03 坐标: 49659411-49662370 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003208`
名称	SmilChr03G003208
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49659411 - 49662370 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016353`
GeneID	`131016353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016353`
原始查询	`SmilChr03G003208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
产物	protein LONGIFOLIA 1-like
Arabidopsis	`AT3G63430` (TRM5) zinc finger CCCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825518] identity=43.7; qcov=0.425; evalue=5.47e-64; confidence=low
Rice	`Os11g0587300` - identity=31.3; qcov=1.09; evalue=4.44e-68; confidence=low
GO	GO:0051513 (regulation of monopolar cell growth)
KEGG	-
Pfam	PF14309 (DUF4378); PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801033.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057801033.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801033.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801033.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49659736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:49659924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C37,D7
`Chr3:49660131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:49660205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8
`Chr3:49660246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A10,A16,A18,A20,A24,B102,B11,B133,B135,B14,B2,B26,B3,B38,B46,B88,B94,C42,C55,C64,C70,C71,C77,C87,C9,D10,D2
`Chr3:49660297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:49660316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:49660423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A24,A4,B133,C64
`Chr3:49660480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B133,B14,B24,C64
`Chr3:49660635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:49660772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B86,C13,C38,C59
`Chr3:49660860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A20,B44,B98,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801033.1

744 aa

372

744

VARLMGL

DUF4378

PF14383 VARLMGL 137-162 aa PF14309 DUF4378 573-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801033.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	137	162	2.9e-08	33.8	DUF761-associated sequence motif
`XP_057801033.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	573	713	9.4e-17	62.6	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945050.1
GCGGGAGTTGTGTTGAAGTGAGTTAAAGCTCAAGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGCTCCCAAATATGAAGCTAACTTAGGTGTGGGTGTGCGTGTGTTGCGTGAGTGCTTAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTACAGTTATCGGAGTTTGACGTCAGCGGCGGCAAAATGTCAGCAGGCATGGTGAACGAGCAGTGCTTCGAGAAGCACATAGACAAACAAATGGGTTGCATGACCGGCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016353
ATGTCAGCAGGCATGGTGAACGAGCAGTGCTTCGAGAAGCACATAGACAAACAAATGGGTTGCATGACCGGCTTCCTTCAAATCTTCGATCGCCACCAGATTCTCTCCGGAAAACGCCACTACCCCGCCAAGCGTCTCCCTCCCTCTCCGGTGTTTGATACAACGTCGGAGTCGGAGAAGTCAGCCCCCGCGTCACCGGCGATCTCGACGGTGACAGCAGCGAGTCCGGAGCTCCCAATGTTCGGCATGAAAGAAGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801033.1
MSAGMVNEQCFEKHIDKQMGCMTGFLQIFDRHQILSGKRHYPAKRLPPSPVFDTTSESEKSAPASPAISTVTAASPELPMFGMKEGTKCSWKFSKEAPRLSLDSRATTDTKGSLHPKEIRTAASILAAANRCDGNESVDGQQHRSPSVIARLMGLEPLPDSSCFEPEIKPELRRSASESRVSRDLFHSRFISERSNFSSNQPTEAVDVNSPRFSDPINYLLKNAKVDTPKAFNRGSGFHSPSLWNAPRHRKSFFDSGDFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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