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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003212`

染色体: Chr03 坐标: 49743419-49745671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003212`
名称	SmilChr03G003212
描述	uncharacterized SmilChr03G003212
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49743419 - 49745671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016358`
GeneID	`131016358`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016358`
原始查询	`SmilChr03G003212`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G22970` (AT3G22970) - identity=60.7; qcov=0.776; evalue=2.75e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0796600` - identity=43.5; qcov=0.708; evalue=1.77e-68; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016358

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801036.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801036.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801036.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801036.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49744134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:49744246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:49744806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:49745053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:49745095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B87
`Chr3:49745161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:49745187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B128,B44,C50
`Chr3:49745240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D5
`Chr3:49745243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801036.1

380 aa

190

380

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 76-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801036.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	76	285	8.8e-73	245.6	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945053.1
CTGCTATTCCTAGCAGCTGCTCCTTCACACTACACTAAACCATCACGCTCCATTTCTCTCCCCACCTATTCACACACTCACCGTGTTTGTGCGTGCGTCAGATATTTTTTTCTCTTTCTCGCCGGAAATGAAGATTCCGGCTTCTGATGATCGGATTCCAGGCTGCCGGAGAACTGATGTCATGTTGTTAGTTCCTTTTTCTCCACTTCTGATTTTGAATGTTGACGTTCGCCCGTAATTGAAAACCCAAAGCAAAGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016358
ATGCCTCAAACCATGAAAATTCAACCGATCGATTTCAACGAGGCGGAGGAACCGACGGCGAAATGTGAGGCAGTTGCGAAGCCAGTATTTAGGTCGAGGTTCAAGTGGCTTTTCGAGAGGCCGTTCTCCAGAGCTCCGGTGACGGAAAAGCCAGCCGGCGCCGCTGAGCCGCTGACTAACAAGGACGGATTGGAGGAGTTTGAGCCTAGCTCGGTTTGCCTTGCGAAGATGGTCCAGAATTTTATGGAGGAAAACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801036.1
MPQTMKIQPIDFNEAEEPTAKCEAVAKPVFRSRFKWLFERPFSRAPVTEKPAGAAEPLTNKDGLEEFEPSSVCLAKMVQNFMEENNEKQQHKCGRNRCTCFNGNCTDSSDDEPDSCNSSFSQACDTLKSLVPCVCVSEKNLLADTAKIVERHKINKRKDGFCRKIVADGLIALGYDAAICKSKWEKSPSFLAGEYEYVDVIIEGERLIIDIDFRSEFAIARPTKSYKLLLQTLPNIFIGKSDRLEKIIGIVSDAVKQSLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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