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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003214`

染色体: Chr03 坐标: 49752876-49754132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003214`
名称	SmilChr03G003214
描述	uncharacterized SmilChr03G003214
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49752876 - 49754132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018936`
GeneID	`131018936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018936`
原始查询	`SmilChr03G003214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G34320` (AT2G34320) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994] identity=26.3; qcov=0.682; evalue=7.94e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=23.1; qcov=0.787; evalue=9.69e-11; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803603.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803603.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803603.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803603.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49752904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A5,B6,C54,C63
`Chr3:49752926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B121,B124,B49,B79
`Chr3:49752943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B31,C47,C75
`Chr3:49752951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A6,B97,C37,C38
`Chr3:49752951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B97,C37,C38
`Chr3:49752964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:49752995`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A13,A9,B100,B105,B114,B119,B28,B5,C36,C43,C51,C53,C70,D4
`Chr3:49753006`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A15,B98,C34,C85,D7
`Chr3:49753006`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A15,B98,C34,C85,D7
`Chr3:49753019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B62,B68,C12
`Chr3:49753021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A21,A9,B110,B118,B123,B128,B139,B14,B21,B22,B33,B37,B41,B5,B52,B76,B77,B80,B85,B96,C17,C37,C45,C5,C50,C52,C62,C83
`Chr3:49753026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803603.1

418 aa

209

418

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 62-141 aa PF13456 RVT_3 269-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803603.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	62	141	1e-17	65.2	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057803603.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	269	388	1.9e-17	64.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947620.1
ATGATACCTTATTTCTCTCAGAACATTTCGGATTACTTTTTTGATAATAAGTGGCACCTCACTTCTAGTTTTGTGCAGTCTTTCCCGTGTATTGCTCTTGACATCATTTCCACCCCCATTCCTGGGGTTGCCAGCGATAGATCCTGGATACATTCGGGGTTCGGGGACATTACTGCTGCTTTGGCCTTTGCTCACATTCGTCCTCAGTTCCCTAAGGTAGACTGGGGCTCCTGGATTTGGGCCCCTTTTATTCCCTCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018936
ATGATACCTTATTTCTCTCAGAACATTTCGGATTACTTTTTTGATAATAAGTGGCACCTCACTTCTAGTTTTGTGCAGTCTTTCCCGTGTATTGCTCTTGACATCATTTCCACCCCCATTCCTGGGGTTGCCAGCGATAGATCCTGGATACATTCGGGGTTCGGGGACATTACTGCTGCTTTGGCCTTTGCTCACATTCGTCCTCAGTTCCCTAAGGTAGACTGGGGCTCCTGGATTTGGGCCCCTTTTATTCCCTCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803603.1
MIPYFSQNISDYFFDNKWHLTSSFVQSFPCIALDIISTPIPGVASDRSWIHSGFGDITAALAFAHIRPQFPKVDWGSWIWAPFIPSRRSLLVWRTIVGKLPTFDMSRLHGIQGPNRCPLCSEAEESLDHVLLNCSFSTSIWADFFRWFSIDQPLPSDVGSLVRFSIQQKNIKQIGNLWKVGVISLLWSLWSHRNNIIHKDLAPSRHLIIKQVRVFICEAANNFDLGPMENSVSDLLILKKLSIAGQPRKPISYIYVAWHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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