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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003215`

染色体: Chr03 坐标: 49791093-49794426 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003215`
名称	SmilChr03G003215
描述	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49791093 - 49794426 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018938`
GeneID	`131018938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018938`
原始查询	`SmilChr03G003215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1-like
产物	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1-like
Arabidopsis	`AT2G20635` (AT2G20635) protein kinase and Mad3-BUB1-I domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816591] identity=56.2; qcov=0.781; evalue=1.84e-121; confidence=high
Rice	`Os07g0508500` (BRK1) - identity=46.9; qcov=0.811; evalue=4.06e-100; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007094 (mitotic spindle assembly checkpoint signaling); GO:0051754 (meiotic sister chromatid cohesion, centromeric)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803604.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803604.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803604.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803604.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49792725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:49792751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:49792764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A14,A16,B108,B117,B126,B133,B134,B138,B43,B54,B57,B69,B88,B95,C22,C30,C38,C40,C60,C74,C87,D11,D5
`Chr3:49792785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C79
`Chr3:49792785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:49793248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A3,C11,C69,D9
`Chr3:49793279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C20
`Chr3:49793631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr3:49793862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:49794042`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B109,B34,B67,D4,D5
`Chr3:49794042`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B109,B34,B67,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803604.1

392 aa

196

392

Pkinase

PF00069 Pkinase 231-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803604.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	231	364	1.3e-08	35.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947621.1
ATGGTACAATGTTGGGTGGCTGATTTGAGCCCTTTGTGTACTATGGTATGGCTGGAGTATGGGGTAGCTCAGCTGGTGTCTGGTTATTTCGGAGAAGAACAGGAAAGAGATCTCCAAGTACAGGCTATTTTGGACAAGCAAAGCTATAGTGGTTATGGAAACGAGTGGTGCTGGAAAATGTTCTTTCTGATTTTATGGATTATGTTCGTGATCTGCTGCAACAAAAATGCAATGGATGGTAGCTCAGATTATGAAAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018938
ATGGTACAATGTTGGGTGGCTGATTTGAGCCCTTTGTGTACTATGGTATGGCTGGAGTATGGGGTAGCTCAGCTGGTGTCTGGTTATTTCGGAGAAGAACAGGAAAGAGATCTCCAAGTACAGGCTATTTTGGACAAGCAAAGCTATAGTGGTTATGGAAACGAGTGGTGCTGGAAAATGTTCTTTCTGATTTTATGGATTATGTTCGTGATCTGCTGCAACAAAAATGCAATGGATGGTAGCTCAGATTATGAAAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803604.1
MVQCWVADLSPLCTMVWLEYGVAQLVSGYFGEEQERDLQVQAILDKQSYSGYGNEWCWKMFFLILWIMFVICCNKNAMDGSSDYERVFKEIEEHRICIRKALLYESFALFLEVKGRLIDACMIYHLGISRNAEPLGRLKKAQVLFLERMSERVTNGSFQKMKNDISVEDGENFINPWSVSTLKNLLQKMNSKVVEYEGYHSSNKAYPGKVALSSLQKSAKNKDITIGRENYQIRGRAGQGGFAQVFKAYVDGQPDDVVAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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