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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003216`

染色体: Chr03 坐标: 49798371-49799583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003216`
名称	SmilChr03G003216
描述	protein ELC
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49798371 - 49799583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016359`
GeneID	`131016359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016359`
原始查询	`SmilChr03G003216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ELC
产物	protein ELC
Arabidopsis	`AT2G38830` (AT2G38830) Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818467] identity=39.9; qcov=0.981; evalue=1.9e-74; confidence=medium
Rice	`Os02g0833300` - identity=32.1; qcov=1.14; evalue=1.33e-45; confidence=low
GO	GO:0000813 (ESCRT I complex); GO:0008333 (endosome to lysosome transport); GO:0015031 (protein transport); GO:0036211 (protein modification process); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03272 (Virion - Hepatitis viruses - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05743 (UEV); PF09454 (Vps23_core)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801037.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801037.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801037.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801037.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49798640`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr3:49798640`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr3:49798662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr3:49798774`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,B86
`Chr3:49798774`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr3:49798794`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr3:49798794`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr3:49798799`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr3:49798799`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr3:49798809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B120,B137,B139
`Chr3:49798836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C13
`Chr3:49798878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B126,B135,B33,B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801037.1

322 aa

161

322

UEV

Vps23_core

PF05743 UEV 27-148 aa PF09454 Vps23_core 253-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801037.1`	Pfam	`PF05743`	UEV	Domain	27	148	1.5e-19	70.8	UEV domain
`XP_057801037.1`	Pfam	`PF09454`	Vps23_core	Domain	253	313	1.7e-16	60.7	Vps23 core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945054.1
GAGTCGTCTTTATAAATAATTAGCACGAAAGCAACCATTTGTTGCATGCCAATCCCACATATCTATATTAGTCAGTCTCCAAATCTTTCACAATATCCATATATCTAATCACATGAGAAATTCATCAACAAGATTCATCGAAGACGCCCTCTTCTGCTCCGACCCGTTGGCCCTATCCTACTCCGACCCGGATCAGAAATGGATCATCCGGCAACACCTCATCTCCCTCCTCCACGACTTCCCTTCACTCAAACCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016359
ATGAGAAATTCATCAACAAGATTCATCGAAGACGCCCTCTTCTGCTCCGACCCGTTGGCCCTATCCTACTCCGACCCGGATCAGAAATGGATCATCCGGCAACACCTCATCTCCCTCCTCCACGACTTCCCTTCACTCAAACCCTCCGTCGCCGTCTTCACCCACAACGACGGCACCGACGTCAAGCTCCTCCTCGCCTCCGGCGACCTCCCCGTCTCCCCGCCCGTGCCCCTCACCATTTGGGTGCACGAGCTTTACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801037.1
MRNSSTRFIEDALFCSDPLALSYSDPDQKWIIRQHLISLLHDFPSLKPSVAVFTHNDGTDVKLLLASGDLPVSPPVPLTIWVHELYPHVPPIVYVNAAPHPIHDHYPFADPASGAAASAYIASWHFARSTLSGLAHNLVRLFCHSHPFCHTGGSDSWAHHPSLASRMEATDRLACSVYSDAAAMATEARREIEDLAAVQAALKERSEALAIAVRQLEGERRGLKWRSDKMSEEADRLQNWLKVYAGCAAIDDAFEGVDAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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