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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003217`

染色体: Chr03 坐标: 49803637-49810617 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003217`
名称	SmilChr03G003217
描述	uncharacterized SmilChr03G003217
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49803637 - 49810617 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016360`
GeneID	`131016360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016360`
原始查询	`SmilChr03G003217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Guanylate-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818468]; symbol=AT2G38840; hit=AT2G38840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Guanylate-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818468]; symbol=AT2G38840; hit=AT2G38840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G38840` (AT2G38840) Guanylate-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818468] identity=80.9; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0181700` - identity=73.1; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF02263 (GBP); PF02841 (GBP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057801038.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057801038.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057801038.1`
4	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	0.20000	`XP_057801038.1`
5	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.20000	`XP_057801038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49803978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C37
`Chr3:49804934`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	26	A1,A13,A6,B11,B111,B139,B31,B35,B42,B43,B48,B5,B61,B64,B65,B72,C3,C31,C34,C35,C37,C40,C43,C45,C47,C63
`Chr3:49807119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:49808743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C72,D11,D6
`Chr3:49808964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B23
`Chr3:49809560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C29,C39,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801038.1

599 aa

300

599

GBP

GBP_C

PF02263 GBP 42-286 aa PF02841 GBP_C 294-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801038.1`	Pfam	`PF02263`	GBP	Domain	42	286	3.4e-38	132.1	Guanylate-binding protein, N-terminal domain
`XP_057801038.1`	Pfam	`PF02841`	GBP_C	Domain	294	423	1.4e-10	41.8	Guanylate-binding protein, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945055.1
CTTTAAACGTGCAAATAATCCTCTACTTTGCGGCTCACTGTAGTCACGGATGAAGAATACTCGTCTTCCCTCACACCTTCAACTTTCAAGATCCGAAATCCAGTTACAAAAAAAAAGCATAACTTTGAGCCTCAACAACAGTTGAAATTCTTATTTTTATCCTCGAGATCCCCACTCCCGTCCCCCTCTCGAAAACCCCCATTTTCCCGTTCCTTGTGATTGCTACCGTACCATCTTTATGCTCTTAACTGCACTGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016360
ATGCGGGCGTTGAGTCCGGTTGCCGTTTTGGCCATTTTTCTGTCGTTTTTCGTATCTGGGTCGCTCTCTATTGACAATTTTCGTCAAGCATTTCCTATCATAGAACCAGATCCTGGCCACACAAAACTTCGCTTGTCAAGAGAAGGCCTGGAAGCAATTGAGAAAATCACCACACCTATATCAGCTGTTGCTGTCATTGGTCCATATCGGTCTGGGAAATCATTTCTACTTAACCAGCTTCTCTCTCTATCATGCTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801038.1
MRALSPVAVLAIFLSFFVSGSLSIDNFRQAFPIIEPDPGHTKLRLSREGLEAIEKITTPISAVAVIGPYRSGKSFLLNQLLSLSCYEGFGVGHMRDTKTKGIWVWGTPVEVDINGVKTSVFYLDTEGFESVGKSNVYDDRIFALATVMSSVLIYNLPETIREADISRLSFAVELAEEFYGRVKGQDVAFEPAKLLWLIQRDFLQGKSVQEMVDEALRRVPNANEDKNIDQVNQIRESLAVMGDNSTAFSLPQPHLQRTKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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