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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003256`

染色体: Chr03 坐标: 50448036-50451466 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003256`
名称	SmilChr03G003256
描述	iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50448036 - 50451466 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014159`
GeneID	`131014159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014159`
原始查询	`SmilChr03G003256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase, mitochondrial
产物	iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G19540` (INDH) INDH1(iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827696] identity=68.2; qcov=0.914; evalue=3.09e-132; confidence=high
Rice	`Os03g0627300` (OsISC37) - identity=63.6; qcov=0.442; evalue=9.98e-50; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0032981 (mitochondrial respiratory chain complex I assembly); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0140663 (ATP-dependent FeS chaperone activity)
KEGG	-
Pfam	PF01656 (CbiA); PF09140 (MipZ); PF10609 (ParA); PF13614 (AAA_31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798026.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057798026.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798026.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798026.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50448515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:50450476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C74
`Chr3:50450489`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr3:50450489`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798026.1

292 aa

146

292

ParA

AAA_31

MipZ

CbiA

PF10609 ParA 31-274 aa PF13614 AAA_31 33-72 aa PF09140 MipZ 34-137 aa PF01656 CbiA 35-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798026.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	31	274	3.6e-100	335.2	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase
`XP_057798026.1`	Pfam	`PF13614`	AAA_31	Domain	33	72	7.2e-09	36.5	AAA domain
`XP_057798026.1`	Pfam	`PF09140`	MipZ	Domain	34	137	7.8e-06	26.1	ATPase MipZ
`XP_057798026.1`	Pfam	`PF01656`	CbiA	Domain	35	203	1.3e-11	45.2	CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942043.1
CATTTTGTTACCCAACGGGCCTTGCAGTTTAGAAGCCCAAATTTCAAAATTCGGGCTTGGACATGCCCATGTCAGCCCGACTCACTTTCTCTTCATCAATAGAATTTGATCACCAATAGGCAATAACCACTCTTCTTGCGCTATTGAGCATCAATCTTGGAAATTAATCAGAAACTTCAGAATTAATGAACCAGCTTCTGAGACAATGTTCACGCGGAGGGTTCAGGGGTTTCGCCTCGCAGAGCGGAAAGGGGCAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014159
ATGAACCAGCTTCTGAGACAATGTTCACGCGGAGGGTTCAGGGGTTTCGCCTCGCAGAGCGGAAAGGGGCAAAATCTGAAGATCGAAGGGGTTAAGGACATAATAGCTGTTGCTTCTGGCAAAGGTGGCGTCGGCAAGTCCACAACTGCTGTTAATTTGGCTGTTTCGCTTGCAAATAAGTGGCAGCTTAAGGTTGGGCTGCTGGATGCTGATGTTTACGGGCCATCCATTCCGACGATGATGAAGCTCCATGGAAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798026.1
MNQLLRQCSRGGFRGFASQSGKGQNLKIEGVKDIIAVASGKGGVGKSTTAVNLAVSLANKWQLKVGLLDADVYGPSIPTMMKLHGKPEFSADKKMIPIENYGVKCMSMGSLVAEGEALVWRGPMVMKALEQMTRGVDWGMLDVLVVDMPPGTGDAQISISQRLQLSGALIVSTPQDVALMDARRGVKMFSQVNVPILGIVENMSYFKCPSCNEAHYIFGKGGAQKTADVMGMRFLGELPLETGIRSGSDEGVPIVISNPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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