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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003267`

染色体: Chr03 坐标: 50592638-50599731 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003267`
名称	SmilChr03G003267
描述	uncharacterized SmilChr03G003267
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50592638 - 50599731 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014170`
GeneID	`131014170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014170`
原始查询	`SmilChr03G003267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Membrane fusion protein Use1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824725]; symbol=AT3G55600; hit=AT3G55600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Membrane fusion protein Use1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824725]; symbol=AT3G55600; hit=AT3G55600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G55600` (AT3G55600) Membrane fusion protein Use1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824725] identity=62.2; qcov=1.05; evalue=2.18e-106; confidence=high
Rice	`Os08g0533700` - identity=62.7; qcov=1.02; evalue=5.41e-94; confidence=high
GO	GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0031201 (SNARE complex)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09753 (Use1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057798041.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057798041.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057798041.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798041.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50592987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B87,C70,D1
`Chr3:50593008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:50593011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C82
`Chr3:50593014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:50593033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C78
`Chr3:50594149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr3:50594177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B47
`Chr3:50596355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B87,C70
`Chr3:50596673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:50596693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B130,B21,B37
`Chr3:50596693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B21,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798041.1

238 aa

119

238

Use1

PF09753 Use1 5-238 aa

XP_057798042.1

238 aa

119

238

Use1

PF09753 Use1 5-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798041.1`	Pfam	`PF09753`	Use1	Family	5	238	5.8e-67	226.6	Membrane fusion protein Use1
`XP_057798042.1`	Pfam	`PF09753`	Use1	Family	5	238	5.8e-67	226.6	Membrane fusion protein Use1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942059.1
AGCCTAACTTCACAATTCAAATTGAATTCCAACTTCTCGGCCCACCCCCCAGCGCCACTCCACTCCACTCTGCAGATCGGAGTCTCCGACTCTCCGACACTGATTGAGCGGCTTCCGGCCGTCCACCTCCGGTCTCGGCGGCTCGGCCACTCCCCACCCGAATTCCCTCTCGGCCACTCCCCAGTCCCCACCTGAAACCCCTCTCGGCTCCTCTCCGCGGTCTCTGCCCAGTCCCCAATCCTCACGGTGAGCAGCTTCTC...

XM_057942058.1
AGCCTAACTTCACAATTCAAATTGAATTCCAACTTCTCGGCCCACCCCCCAGCGCCACTCCACTCCACTCTGCAGATCGGAGTCTCCGACTCTCCGACACTGATTGAGCGGCTTCCGGCCGTCCACCTCCGGTCTCGGCGGCTCGGCCACTCCCCACCCGAATTCCCTCTCGGCCACTCCCCAGTCCCCACCTGAAACCCCTCTCGGCTCCTCTCCGCGGTCTCTGCCCAGTCCCCAATCCTCACGGTGAGCAGCTTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014170
ATGGGCTTGAGCAAAACTGAAGTGAATTTGAGAAGGTTACTTGCAGCAGCTCCGCAGCAACAAAATCAGGGAAAGCTTATACATTATGTGGCCACTTTAAGAGAGCAACTGGAGCAATTGGCTGAAGAGAGGACTCCTGAAGGTTTGCCAAGGGCTTCAAAAGCTCAGTTAAATGAATATTCTGAGAAAATTGAAGCTGTAGCAGCTAAATTAGATGTCACTGAGTCCATTACTCAAGTTCATCAGGAGCCGTCCTTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798041.1
MGLSKTEVNLRRLLAAAPQQQNQGKLIHYVATLREQLEQLAEERTPEGLPRASKAQLNEYSEKIEAVAAKLDVTESITQVHQEPSFETKVRESPTTSDGESIQSPRGLRRRFLPPSGDRSPSTNEDSNNAKSVKLDAAAHAHIEKHRQLQEDLTDEMVGLARQLKESSLMMSQSIKNTEKILDSTETAVEHSLASTGHANSRAMEVYSQSLKTTCFTWLLIFAMTCIFVMVVLLIRVT

XP_057798042.1
MGLSKTEVNLRRLLAAAPQQQNQGKLIHYVATLREQLEQLAEERTPEGLPRASKAQLNEYSEKIEAVAAKLDVTESITQVHQEPSFETKVRESPTTSDGESIQSPRGLRRRFLPPSGDRSPSTNEDSNNAKSVKLDAAAHAHIEKHRQLQEDLTDEMVGLARQLKESSLMMSQSIKNTEKILDSTETAVEHSLASTGHANSRAMEVYSQSLKTTCFTWLLIFAMTCIFVMVVLLIRVT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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