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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003273`

染色体: Chr03 坐标: 50689598-50693702 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003273`
名称	SmilChr03G003273
描述	protein root UVB sensitive 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50689598 - 50693702 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014177`
GeneID	`131014177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014177`
原始查询	`SmilChr03G003273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein root UVB sensitive 2, chloroplastic
产物	protein root UVB sensitive 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G31190` (RUS2) root UVB sensitive protein (Protein of unknown function, DUF647) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817675] identity=75.5; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0517300` (OsRUS2) - identity=72.9; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009926 (auxin polar transport); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0010224 (response to UV-B)
KEGG	-
Pfam	PF04884 (UVB_sens_prot); PF24160 (UVB_sens_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057798052.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057798052.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057798053.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.60000	`XP_057798052.1`
5	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057798052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50689733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,B94
`Chr3:50689878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C5
`Chr3:50689956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B73,B94
`Chr3:50691526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D7
`Chr3:50691727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B3,C38,C77,C87
`Chr3:50692496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:50693397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C2,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798052.1

433 aa

216

433

UVB_sens_prot

UVB_sens_C

PF04884 UVB_sens_prot 59-293 aa PF24160 UVB_sens_C 296-424 aa

XP_057798053.1

389 aa

194

389

UVB_sens_prot

UVB_sens_C

PF04884 UVB_sens_prot 15-249 aa PF24160 UVB_sens_C 252-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798052.1`	Pfam	`PF04884`	UVB_sens_prot	Domain	59	293	4.6e-74	249.8	Vitamin B6 photo-protection and homoeostasis domain
`XP_057798052.1`	Pfam	`PF24160`	UVB_sens_C	Domain	296	424	3.1e-06	28.3	Root UVB sensitive protein, C-terminal
`XP_057798053.1`	Pfam	`PF04884`	UVB_sens_prot	Domain	15	249	3.4e-74	250.2	Vitamin B6 photo-protection and homoeostasis domain
`XP_057798053.1`	Pfam	`PF24160`	UVB_sens_C	Domain	252	380	2.8e-06	28.5	Root UVB sensitive protein, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942069.1
GGTTATTTGGCTAATTTGCATCAGAGCTCGCGCCTATTCTAGAAATTTAGCTGCCATTATTTAATGTCAAGCTTTCTGGCAAAATTCAAGAATTTGCCGGCGAAACTTTTGAAGTCTTATCCATGAATTTCTTCGAAACATTCAAGATGCAAAGGAAGAAATCAGATGAGATGCCGCCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCCGTGTGGTGGATTGAGACTTCCGGTTCAGTGTCCCACCGCTTCCAATTCGAACCCGATGGT...

XM_057942070.1
GAAACATTCAAGATGCAAAGGAAGAAATCAGATGAGATGCCGCCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCCGTGTGGTGGATTGAGACTTCCGGTTCAGTGTCCCACCGCTTCCAATTCGAACCCGATGGTCAATTTTCGAAAGTGGAGCAATAGCTGAGAGGCTGCGAAATACCACCTGTTCTGATGAATGCTGATAAAAATGGTGAAGATGGTTGAAGACACAAGACCTGCCTCCCGTAGGGTGGTTGAATCCTTTCTTAATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014177
ATGAATTTCTTCGAAACATTCAAGATGCAAAGGAAGAAATCAGATGAGATGCCGCCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCCGTGTGGTGGATTGAGACTTCCGGTTCAGTGTCCCACCGCTTCCAATTCGAACCCGATGGTCAATTTTCGGTGAAGATGGTTGAAGACACAAGACCTGCCTCCCGTAGGGTGGTTGAATCCTTTCTTAATAAGTTCTTTCCATCAGGTTATCCATATAGTGTGAATGAAGGCTATCTTAGATA...

LOC131014177
ATGCTGATAAAAATGGTGAAGATGGTTGAAGACACAAGACCTGCCTCCCGTAGGGTGGTTGAATCCTTTCTTAATAAGTTCTTTCCATCAGGTTATCCATATAGTGTGAATGAAGGCTATCTTAGATATACACAATTTCGTGCCTTGCAACACTTCTCCAGCGCAACACTGTCTGTATTATCGACTCAGTCGCTGTTATTTGCTGCAGGCTTGCGACCTACACCCGCTCAGGCTACAGCTGTTAGTTGGATATTAAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798052.1
MNFFETFKMQRKKSDEMPPPPPPPPPVWWIETSGSVSHRFQFEPDGQFSVKMVEDTRPASRRVVESFLNKFFPSGYPYSVNEGYLRYTQFRALQHFSSATLSVLSTQSLLFAAGLRPTPAQATAVSWILKDGMQHVGKLICSNLGARMDSEPKCWRILADVLYDFGTGLEIISPLCPQLFLEMAGLGNFAKGMAVVAARATRLPIYSSFAKEGNLSDLFAKGEAISTLFNVLGIGAGIQLASTVCSSTQGKLVVGPLLSA...

XP_057798053.1
MLIKMVKMVEDTRPASRRVVESFLNKFFPSGYPYSVNEGYLRYTQFRALQHFSSATLSVLSTQSLLFAAGLRPTPAQATAVSWILKDGMQHVGKLICSNLGARMDSEPKCWRILADVLYDFGTGLEIISPLCPQLFLEMAGLGNFAKGMAVVAARATRLPIYSSFAKEGNLSDLFAKGEAISTLFNVLGIGAGIQLASTVCSSTQGKLVVGPLLSAFHIYCVREEMRATPVNTLNPQRTAMIVAEFLKSGRISSPADLRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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