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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003277`

染色体: Chr03 坐标: 50732186-50733430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003277`
名称	SmilChr03G003277
描述	ethylene-response factor C3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50732186 - 50733430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014178`
GeneID	`131014178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014178`
原始查询	`SmilChr03G003277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-response factor C3-like
产物	ethylene-response factor C3-like
Arabidopsis	`AT3G23240` (ERF1) ethylene response factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821902] identity=59.1; qcov=0.83; evalue=2.51e-68; confidence=high
Rice	`Os03g0860100` (OsERF#083) - identity=59.7; qcov=0.643; evalue=2.62e-47; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009873 (ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798054.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798054.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798054.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798054.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50732587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C37
`Chr3:50732598`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr3:50732598`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B22
`Chr3:50732688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B21,B37
`Chr3:50732839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:50732848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B15,B66,C22
`Chr3:50732854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B87
`Chr3:50732878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:50732963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:50733112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:50733145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798054.1

224 aa

112

224

AP2

PF00847 AP2 82-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798054.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	82	132	2.1e-14	54.3	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942071.1
TGCAAACCAAGTTATAACAAAAACATCCCCCCTTGTTTATTTTTAATTTTATATGTCACTTATACCTATGTCCAATTTAACCCCACCCTACTATATTACAAATAAATTTTCCCTATATTGTTTTCTCAAATAATCCATTTTTCGCAGGGTATATAAAGGCCCCAAAGTTCAAAAAGTATCGTCAAAGTTGTGAGGAGAAAAATCTTGTTAGCAAATGCAAACTCAAACTCAAACTCAAACACAGAGACAGATGATGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014178
ATGCAAACTCAAACTCAAACTCAAACACAGAGACAGATGATGGAGTCTTCATTCTTCCAATTCTCATTCCCCGACTCCCCTCATTCCCTCTCGTGGGAACACGACGACGGCGGCGTCTCCGGACTCCCTTTTAACGTTAACGACTCCGAGGAGATGCTCCTCTACGGCGTGCTAGCGCAAGGGGCCGCCGGCGGGGAGGCCGTGAAGGTGGAGGAGGAGGTGAGCTCCGAGAAGAGGGTGAAAGCGTACAGGGGGGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798054.1
MQTQTQTQTQRQMMESSFFQFSFPDSPHSLSWEHDDGGVSGLPFNVNDSEEMLLYGVLAQGAAGGEAVKVEEEVSSEKRVKAYRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRNGVRVWLGTFDNAEAAALAYDQAAFAMRGCAAVLNFPVERVKESLQEMKCGVEEGCSPVMALKRKHSMRKKRSVNRKIMHLDKGGSHDHTTVVVLEDLGVEILESLLSCSSSSSPSSSQSW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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