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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003288`

染色体: Chr03 坐标: 50980166-50981965 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003288`
名称	SmilChr03G003288
描述	uncharacterized SmilChr03G003288
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50980166 - 50981965 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018952`
GeneID	`131018952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018952`
原始查询	`SmilChr03G003288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=40; qcov=0.148; evalue=8.64e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=34.1; qcov=0.237; evalue=3.07e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803619.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803619.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803619.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803619.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50980177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A3,B105,B136,B38,B44,B85,B94,C24
`Chr3:50980185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C22,C4
`Chr3:50980193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C4
`Chr3:50980197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B10,B15,B66,C22
`Chr3:50980197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B15,B66,C22
`Chr3:50980246`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B100,B47,C38
`Chr3:50980246`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B100,B47,C38
`Chr3:50980247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B91,C5,C74
`Chr3:50980249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A2,A24,B119,B18,B36,B37,B52,B59,B74,B84,B95,C13,C18,C23,C25,C29,C35,C43,C46,C72,C74,C80,D8
`Chr3:50980259`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A2,A24,B1,B11,B132,B135,B18,B33,B36,B59,B68,B70,B87,C13,C29,C4,C40,C43,C45,C53,C69,C80,D1,D11
`Chr3:50980603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A14,A20,A5,B108,B119,B127,B22,B37,B64,B87,C27,C32,C68,C84,C86,D8
`Chr3:50980617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B138,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947636.1
ATGTTCATAGATACAGCAGCTGGAGGTTCCCTGCTCAAGAAAGGGAGCTCGGAGGCTATGGAGATCATTGAAAGCATGGCCACTACCAGTTATCAATGGCTATCCGAGAGAGTGCAGTTGAAGAAAATTGTTGTTGCGTCTAGCTCAGATCCCATGGCATTGATTTTGACTCAACTGGCAGAAATGAACTCGAGAATTGCAGCGTTAACTTTGGGCAATCCTGAGCCGGCTGTGGAGATCCCAACAGGCATAGAAGACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018952
ATGTTCATAGATACAGCAGCTGGAGGTTCCCTGCTCAAGAAAGGGAGCTCGGAGGCTATGGAGATCATTGAAAGCATGGCCACTACCAGTTATCAATGGCTATCCGAGAGAGTGCAGTTGAAGAAAATTGTTGTTGCGTCTAGCTCAGATCCCATGGCATTGATTTTGACTCAACTGGCAGAAATGAACTCGAGAATTGCAGCGTTAACTTTGGGCAATCCTGAGCCGGCTGTGGAGATCCCAACAGGCATAGAAGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803619.1
MFIDTAAGGSLLKKGSSEAMEIIESMATTSYQWLSERVQLKKIVVASSSDPMALILTQLAEMNSRIAALTLGNPEPAVEIPTGIEDANYINDRNYGNFQHRQQGGYNSGQQFHHGGRRQPNLAYENLNNAIQPPPGFSVTNGVINEEKKPNIEELLMKFMSKSDERMEKLESNAAAVGTQMKMIVDLPSGTTQEGPKTTKYESAPPFEEKAEERHKKERMKERLYKFLEIFKKVNINVPLVEMLLEMPHNAKFLKNIVSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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