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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003289`

染色体: Chr03 坐标: 50997014-50998529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003289`
名称	SmilChr03G003289
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 12-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50997014 - 50998529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014188`
GeneID	`131014188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014188`
原始查询	`SmilChr03G003289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 12-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 12-like
Arabidopsis	`AT5G59540` (AT5G59540) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836073] identity=42.4; qcov=1; evalue=1.31e-106; confidence=medium
Rice	`Os08g0392100` - identity=42.3; qcov=0.997; evalue=1.2e-83; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798063.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798063.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798063.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798063.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50997282`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A14,B25,B63,B71,B90,B92,C38,C54,C55,C66,D5,D8
`Chr3:50997287`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A14,A3,B25,B63,B71,B90,B92,C38,C54,C55,C6,C66,D5,D8
`Chr3:50997309`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A14,B25,B63,B83,C55,D5,D8
`Chr3:50997506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C70
`Chr3:50997651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:50997823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D11
`Chr3:50997988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D1
`Chr3:50997988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:50998159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B88,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798063.1

365 aa

182

365

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 60-159 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 214-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798063.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	60	159	9.8e-20	72.1	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057798063.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	214	311	1.2e-27	96.8	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942080.1
TATTTCATCATACACTCAATCACTCAACCATACATATACAGCAAGTAGTAGCACAAGGAATTTATCTTAATTTTGAGCATATTTATTTGAAAATGGTGGCTTCTTGCAACGTGGAGTTCGATTGGGCTAAAGAAATTAAGGAATTCGACGAAACAAAAGCCGGCGTGAAGGGTCTGGTGGATGCCGGAGTGAAGGAGATACCTCGTCTCTTCGTGCATCCGCAGGAGGTGTTGGAGCGCCACCCGACCGCCAAGGACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014188
ATGGTGGCTTCTTGCAACGTGGAGTTCGATTGGGCTAAAGAAATTAAGGAATTCGACGAAACAAAAGCCGGCGTGAAGGGTCTGGTGGATGCCGGAGTGAAGGAGATACCTCGTCTCTTCGTGCATCCGCAGGAGGTGTTGGAGCGCCACCCGACCGCCAAGGACGTGGCGGTGGAGCTGCCGGTGATCGACTTGAGCGGGGCGGAGCGTGGCGGAGCAAGGCGGAGGGAGGTGGTGGAGGCGATCAGTAAGGCGGCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798063.1
MVASCNVEFDWAKEIKEFDETKAGVKGLVDAGVKEIPRLFVHPQEVLERHPTAKDVAVELPVIDLSGAERGGARRREVVEAISKAAREWGFFSIVKHGIPLETMDAMLECIKIFHELPKEEKIPLYTTERNKPVKWNSNLPAQQNDPACWRDVLNIVYTDDHLEAEEIPSACRKELEEYVKYMIQVRELMAELISEALGLPADYLSKMECMKSQSLSCLYYPACPEPHKTLGAPKHSDTTFLTLLIQDRLGGLQMLRHNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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