当前解析结果
SmilChr03G003300| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003300 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003300 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003300 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 51101324 - 51104625 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014194 |
|---|---|
| GeneID | 131014194 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014194 |
| 原始查询 | SmilChr03G003300 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0279200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0279200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT5G59870 (HTA6)histone H2A 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836109] identity=60.6; qcov=0.232; evalue=1.92e-17; confidence=weak |
| Rice | Os03g0279200- identity=61.9; qcov=0.222; evalue=1.63e-17; confidence=weak |
| GO | GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014194 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057798068.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057798071.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057798071.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057798070.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798068.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:51101650 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
9 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。