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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003303`

染色体: Chr03 坐标: 51217388-51218841 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003303`
名称	SmilChr03G003303
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51217388 - 51218841 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014198`
GeneID	`131014198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014198`
原始查询	`SmilChr03G003303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like
Arabidopsis	`AT1G06620` (AT1G06620) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837171] identity=47.8; qcov=0.967; evalue=2.68e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0690500` - identity=43; qcov=1.02; evalue=1.77e-94; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798075.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798075.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798075.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798075.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51217615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B88,C73
`Chr3:51217759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C30,C54
`Chr3:51218037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B129
`Chr3:51218070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B129,B2,C72
`Chr3:51218123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B132,B2
`Chr3:51218158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C13
`Chr3:51218175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C73
`Chr3:51218201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B92
`Chr3:51218382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B104,B87,C70
`Chr3:51218447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B35,C37
`Chr3:51218506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B35,C37
`Chr3:51218549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798075.1

368 aa

184

368

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 62-164 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 216-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798075.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	62	164	1.7e-20	74.5	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057798075.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	216	313	3.7e-29	101.7	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942092.1
TCGCGAATTGCAAAATAGTCCCATCCACCTCATTCATTCCTCCTCCATTATTACTCCTTGGCATCTGAAAAAAATGGTGAGTTCCAGCAATGGCGACTACGATTGGGCCAAGGAAGTTAAAGAAATCGACGAAACAAAAGCCGGTGTGAAAGGTCTTGTCGATACCGGCATAACAAACATCCCCAAAATCTTCGTGCATCCGAAGACCAGTTTCGAGACCCATCCTCCACCACCCACACCCGCCCACGGCTCCGATCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014198
ATGGTGAGTTCCAGCAATGGCGACTACGATTGGGCCAAGGAAGTTAAAGAAATCGACGAAACAAAAGCCGGTGTGAAAGGTCTTGTCGATACCGGCATAACAAACATCCCCAAAATCTTCGTGCATCCGAAGACCAGTTTCGAGACCCATCCTCCACCACCCACACCCGCCCACGGCTCCGATCTGCCGACGATCGACTTCCAAGGGCTGCGGAGCGGAGGTGAAGGGCGGCGCGTGGTGGTGGAGGAAATCCGCAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798075.1
MVSSSNGDYDWAKEVKEIDETKAGVKGLVDTGITNIPKIFVHPKTSFETHPPPPTPAHGSDLPTIDFQGLRSGGEGRRVVVEEIRKAAQEWGFFRIVNHSIPVETMDAMLAAVKRFHELPHHEKAAFYTTDQRRSVKFNSNLPERENELGCWRDILSFLFYDDQLEPEEIPSACREQVQEYVKHVIQLREVMAELLSEALGLRSDYLSSMECMKSEALACLYYPKCPEPHKTFGNKSHSDTTFLTLLMQDTIGGLQILHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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