当前解析结果
SmilChr03G003311| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003311 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003311 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003311 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 51358897 - 51359364 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018958 |
|---|---|
| GeneID | 131018958 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018958 |
| 原始查询 | SmilChr03G003311 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G43760 (AT1G43760)DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=33.9; qcov=0.819; evalue=2.95e-13; confidence=low |
| Rice | Os06g0484800- identity=35; qcov=0.755; evalue=1.14e-18; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018958 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803624.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057803624.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803624.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803624.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803624.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:51358914 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:51358919 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,B7 |
Chr3:51358966 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:51359051 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr3:51359053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B100,B19,B7 |
Chr3:51359076 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr3:51359092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B79,B95 |
Chr3:51359102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:51359103 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B100,B19,B7 |
Chr3:51359171 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:51359193 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr3:51359231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。