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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003316`

染色体: Chr03 坐标: 51401717-51409726 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003316`
名称	SmilChr03G003316
描述	notchless protein homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51401717 - 51409726 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014209`
GeneID	`131014209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014209`
原始查询	`SmilChr03G003316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	notchless protein homolog
产物	notchless protein homolog
Arabidopsis	`AT5G52820` (AT5G52820) WD-40 repeat family protein / notchless protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835359] identity=80; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0594200` (OsWD40-189) - identity=79.4; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0005515 (protein binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF08154 (NLE); PF12894 (ANAPC4_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798083.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057798083.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798083.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798083.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057798083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51401935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:51405170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B35
`Chr3:51406107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B79,B95
`Chr3:51406706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:51407351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:51407360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B19,B7
`Chr3:51408582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:51408699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B103,B123,B125,B15,B34,B76,B81,C16,C47,C48,C57,C85
`Chr3:51409233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C55,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798083.1

485 aa

242

485

NLE

WD40

ANAPC4_WD40

WD40

PF08154 NLE 23-83 aa PF00400 WD40 111-148 aa PF12894 ANAPC4_WD40 116-171 aa PF00400 WD40 153-190 aa PF00400 WD40 201-238 aa PF00400 WD40 243-278 aa PF00400 WD40 365-400 aa PF00400 WD40 405-442 aa PF00400 WD40 447-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF08154`	NLE	Domain	23	83	4.1e-13	50.3	NLE (NUC135) domain
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	111	148	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF12894`	ANAPC4_WD40	Repeat	116	171	4.6e-22	78.8	Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	153	190	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	201	238	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	243	278	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	365	400	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	405	442	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798083.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	447	483	1.7e-77	253.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942100.1
GGCCCGAGTACTGAAAATTCCAGACTCTAAACCCTAGCAAGTAGCAAGACACTCAAGAAAAACCCAGTTCTTTCATCACAACACAAACAGATAAAAGAAAAGGTTCTAAAACAGAAAAACAGAGAAAAAAAACAAGGAAAGAAAGAAAAAGAGAAGATGGAAGTTGAAGCAGTCGCAGCAGCAGAGGTAGGCATGGCGGAAGAGAGAGAGCAGAGCCACCGCGTCATATGTCAGCTCACGGACACGGAAGGCACGCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014209
ATGGAAGTTGAAGCAGTCGCAGCAGCAGAGGTAGGCATGGCGGAAGAGAGAGAGCAGAGCCACCGCGTCATATGTCAGCTCACGGACACGGAAGGCACGCCGCTCGGATCGCCAATATTCCTGCCGGAAACCGCTGGCCCTAAGGAACTCCAGCAGCTCGTTAATCAGCTTCTCAACAACGAGGAAAAATTGCCTTATGCATTTTATGTGTCGGACCATGAGCTTGCGGTGCAGCTTGGGTCATACCTTCAGAAGAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798083.1
MEVEAVAAAEVGMAEEREQSHRVICQLTDTEGTPLGSPIFLPETAGPKELQQLVNQLLNNEEKLPYAFYVSDHELAVQLGSYLQKNKVSVEKVITIVYQPQAVFRIRPVTRCSSTIAGHTEAVLSVAFSPDGRQLASGSGDTTVRLWDLNTQTPLFTCKGHRNWVLCIAWSPDGKHLVSGSKAGELICWDPQTGKSLGNPLMGHKKWITGISWEPVHLSAPCRRFVSASKDGDARIWDIALKKCIICLTGHTLAITCVKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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