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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003319`

染色体: Chr03 坐标: 51423102-51427189 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003319`
名称	SmilChr03G003319
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51423102 - 51427189 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014213`
GeneID	`131014213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014213`
原始查询	`SmilChr03G003319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2
产物	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2
Arabidopsis	`AT2G31240` (AT2G31240) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817681] identity=60.1; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0820300` - identity=56; qcov=0.828; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF13374 (TPR_10); PF13424 (TPR_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798089.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057798089.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057798089.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057798089.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51423503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,C79
`Chr3:51423531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:51423560`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B43,C61,D3
`Chr3:51423560`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B43,C61,D3
`Chr3:51423647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:51424026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:51424135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:51424320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C11
`Chr3:51424546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:51424863`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	158	A1,A11,A13,A14,A18,A19,A2,A23,A24,A3,A6,A7,A9,B100,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B114,B117,B119,B120,B122,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B139,B140,B15,B19,B2,B20,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B86,B87,B88,B9,B92,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C32,C34,C38,C39,C4,C40,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C68,C7,C72,C73,C74,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C9,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr3:51424873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:51426756`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A16,A20,A5,B101,B106,B107,B12,B126,B132,B21,B28,B31,B35,B40,B47,B64,B72,B80,B89,B91,C26,C27,C29,C30,C36,C42,C44,C54,C57,C6,C67,C69,C87,D1,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798089.1

647 aa

324

647

TPR_10

TPR_8

TPR_10

TPR_12

PF13374 TPR_10 239-265 aa PF13181 TPR_8 478-501 aa PF13374 TPR_10 479-512 aa PF13424 TPR_12 517-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798089.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	239	265	1.5e-24	85.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057798089.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	478	501	3.1e-13	49.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057798089.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	479	512	1.5e-24	85.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057798089.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	517	586	3.5e-35	120.7	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942106.1
ACAACGAGAATATTAATCACTAAAATATTAACAATAAAATACCATAATTAAACAATGTAATTTTTTTTGAGAAATAATTAAACAGTGTAATTGATAGCAAAGGTAGTGCTATCTCTTTTAATACTCCATATACTAGTATATAGATTTTGCAATATCCATTAAAACATATGCAAAAAAGGAAAAAAAGAAGTAAAATTTGATGATAAAAGGAAACACTGGAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGGGCTTTAGTGAGGGTTTAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014213
ATGAGAAGAGCTTCGTCCAAGCTTCTCTCTCATATCCGGAAACCGCATCCCAGAACACCACTTTCTCTCTCTACGAAAGATTTCACTGCCCCCTCCGACCTCTCTCTCAATTGCCCACCAAAACCCCACCTTAAATCCTGCTCCGCCTCTCAATCTTCACTCTTCTCTACCTCCAGTTCCAATTCCAATCGGTTTCAAACTACCTCACCTCAGAATCTCAACTCGCTCGACCTCGTAGACCCAGTTGCCCAGGATGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798089.1
MRRASSKLLSHIRKPHPRTPLSLSTKDFTAPSDLSLNCPPKPHLKSCSASQSSLFSTSSSNSNRFQTTSPQNLNSLDLVDPVAQDASQMSSRQRRIKQKSELEEAFESAESVDEMLAAFKEMEACFDEKDLALACLKIGLKLDREGNDPEKAMSFAQRALRIFDENEGDSSKKMSLPIAMTLHLLGSSSFGLKRFSESLGYLSRANRVLSKVEGESSYNADQVLPILHAVRYELFNVKTAMGRREEAILDLRKALEIKER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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