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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003330`

染色体: Chr03 坐标: 51583607-51585435 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003330`
名称	SmilChr03G003330
描述	patellin-4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51583607 - 51585435 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014224`
GeneID	`131014224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014224`
原始查询	`SmilChr03G003330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patellin-4-like
产物	patellin-4-like
Arabidopsis	`AT1G30690` (AT1G30690) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839949] identity=42.8; qcov=0.839; evalue=8.21e-90; confidence=medium
Rice	`Os01g0874700` (P0698A10.10-2) - identity=37.9; qcov=0.882; evalue=2.88e-79; confidence=medium
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF25099 (GOLD_PATL1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057798095.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798095.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798095.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057798095.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51583913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:51583961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C58,C85,D3
`Chr3:51584085`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A23,A6,B10,B123,B132,B80,B83,C23,C55
`Chr3:51584674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C58,C85,D3
`Chr3:51584788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51584881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C43,D6
`Chr3:51584988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51585055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C44
`Chr3:51585070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:51585223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B113,B26,C40,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798095.1

398 aa

199

398

CRAL_TRIO

GOLD_PATL1_C

PF00650 CRAL_TRIO 125-279 aa PF25099 GOLD_PATL1_C 301-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798095.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	125	279	2e-24	86.9	CRAL/TRIO domain
`XP_057798095.1`	Pfam	`PF25099`	GOLD_PATL1_C	Domain	301	379	5.4e-27	94.2	Patellin-1-like, C-terminal GOLD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942112.1
AAACCAACAGAACTCCACCACTTCTTATTCCCTTGCCTCTCACAAGAAAAAAAAAATCAAAAAACAAAAAAGAGGAGAGGGCCAAAAAGTGTTCCTTGATCGGCTGGTGAGTCTTTGCCGGCCGGAGCTCGGAAGACGCAACAAAACAAAATGATCATCGAGGAGAAGCAGGTGGCAACAAGCGAGGCTCTGTCGGAGAGCGAGGATGAATTGGAAAACGTGGTGGACGCGCGGTCCCGGAGCAAATCCCTGATCGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014224
ATGATCATCGAGGAGAAGCAGGTGGCAACAAGCGAGGCTCTGTCGGAGAGCGAGGATGAATTGGAAAACGTGGTGGACGCGCGGTCCCGGAGCAAATCCCTGATCGAGTTCCGGTTCAGGGTGGAGGAAGCCATCAACGGCAACTACCTGTTCACCAGCAAGGCGGACGGGGAGGCGGAGGAGGCCCGGCTGTGGGGGGTGCCGCTGCTGCCGAGCCAGGGCCACGAGGGCACGGACGCCGTCCTCAACAAGTTCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798095.1
MIIEEKQVATSEALSESEDELENVVDARSRSKSLIEFRFRVEEAINGNYLFTSKADGEAEEARLWGVPLLPSQGHEGTDAVLNKFLKAKRYKVHEAFTALRKTLRWRADFRPADELAPPQDNVWFTSGADKEGRPLCYNVLGKEYQKNLVSLGDQSYQDYLRWRLLCVEEGIRHLNFRPGGVDSVVQILDMRHAGGPTTKEMKLIGKKMITLLHDHYPGIVHKNLIINVPSWFLTLNALNLRMLGKRSKNKFIFVKPSRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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