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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003335`

染色体: Chr03 坐标: 51614051-51618549 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003335`
名称	SmilChr03G003335
描述	FRIGIDA-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51614051 - 51618549 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014229`
GeneID	`131014229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014229`
原始查询	`SmilChr03G003335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FRIGIDA-like protein 5
产物	FRIGIDA-like protein 5
Arabidopsis	`AT1G31814` (FRL2) FRIGIDA like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840070] identity=26.7; qcov=0.328; evalue=3.21e-20; confidence=low
Rice	`Os09g0248200` (P0499G10.20-2) - identity=27; qcov=0.375; evalue=6.78e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798102.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798102.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798102.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51614419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C58,C85,D3
`Chr3:51614658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:51614758`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr3:51614758`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr3:51616399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:51616470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:51616611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B37
`Chr3:51616995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	B13,B132,B135,B14,B19,B2,B23,B27,B29,B4,B41,B43,B48,B52,B54,B58,B71,B86,B91,B93,B98,C11,C19,C23,C26,C31,C35,C37,C38,C39,C4,C44,C48,C53,C55,C57,C60,C69,C78,C87,D2,D5
`Chr3:51616998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	B13,B132,B135,B14,B19,B2,B23,B27,B29,B4,B41,B43,B48,B52,B54,B58,B71,B86,B91,B93,B98,C11,C19,C23,C26,C31,C35,C37,C38,C39,C4,C44,C48,C53,C55,C57,C60,C69,C78,C87,D2,D5
`Chr3:51617014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:51617049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B60
`Chr3:51617049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798102.1

858 aa

429

858

Frigida

PF07899 Frigida 480-738 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798102.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	480	738	7.1e-50	170.7	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942119.1
ACGAGAGAGAAAGATATATACATATATTTTATTTTCTTGTATATAATTCAAATCGGTTCCGATTTCTCTTCGGAGTTTACAAATTACACGTCTACGCCAAACCGCCGAGTTCTGCCGCCTTCAAAAATCTGCCTCGTGGCCAAGGCTTTCACTTTTACCTTTTCTCCTCTCCATTGAAGCCCTAGTTGCAGGTCAAAATTTCTTGTTCTGCATATTTATACATACATTCTGCATATTGTGTGCTTACATAACTGCTTAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014229
ATGGAATCCTTTCCGGCAATGGCGTCGGCGGAGCAACTTCTGTGCGCTCTGAGACGAACGCCGGCGAGAGGCGGTGGGGCTCCCAGCGCGATTATTGATAGGGTGAAGGAGTGGAAGGTTATGGGCGAGAGTGTGTTTAAGGGTTTAGTGGATTGCTTCTCGGATATTGAATCTCGGGAGGAGAATTTGAGGTCGGTTAGCGAGTTGTTGGAGACGCGGTTGGGGGATTTGAAGGAGACGGAGAGGGAATTGAAGTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798102.1
MESFPAMASAEQLLCALRRTPARGGGAPSAIIDRVKEWKVMGESVFKGLVDCFSDIESREENLRSVSELLETRLGDLKETERELKLLHDKKGEALKLSEEELKLREEKLDEQLRLVDEHIEKLEASQGEVDDLRMKERWRLKEIEKRERELEKRLGEFEKRERELEKRLVEFEEREWELLKRLGEFEKRESELLKRLGEFEKREKEIDALHDGKLRELAFKEEVLGKKKTEFVEEVRLANEKIKEKQKLGYELIQRLELA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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