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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003353`

染色体: Chr03 坐标: 51859255-51861492 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003353`
名称	SmilChr03G003353
描述	uncharacterized SmilChr03G003353
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51859255 - 51861492 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014249`
GeneID	`131014249`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014249`
原始查询	`SmilChr03G003353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835278]; symbol=AT5G52030; hit=AT5G52030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835278]; symbol=AT5G52030; hit=AT5G52030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G52030` (AT5G52030) TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835278] identity=59.7; qcov=0.984; evalue=9.6e-143; confidence=high
Rice	`Os08g0545700` - identity=64.6; qcov=0.66; evalue=1.74e-102; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01963 (TraB_PrgY_gumN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014249

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798140.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057798140.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798140.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798140.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51859571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51860284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51860692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51860721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:51861005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C11,C63,C69
`Chr3:51861092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:51861181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798140.1

368 aa

184

368

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 89-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798140.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	89	313	3.5e-14	54.0	TraB/PrgY/gumN family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942157.1
AATTCTTGTGATTGTTTGTCGAGTAAATAAAGTGTGTCCTTATGTTAAACGTTGAGTAAATCCAAATTTCAAGTAAGTTAAACAAGCAAAGCATCATCCTCTTTCTATCCTCACTTCTAATCCTCGTTGCTAGTCACGAATTCCCGGCTCAGTTATCCGTAACAAAGCTCTATTCTGAGTCGGATTTCTGAGCATGAAAGCTTCACGATCTCCATTCCCAATCTTGCCTAAGCTCCGATTCAATATTCAACCATCATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014249
ATGAAAGCTTCACGATCTCCATTCCCAATCTTGCCTAAGCTCCGATTCAATATTCAACCATCATGCACGGCGACGGCGGCATCCGTCATCCCTTCCCCACCTCCCACCTTCAACTTCAAGAAGGAGATTCTCGATATCTCCACCGCCGCAATTGCACAATCCCACCCACAATTACTCGATTTGGCTCAAAATGGCACCTTGGTCCTCCTCACCAAAACCCAGTACGGCCCTGTTCCGCCCTGGAGAAGCGACTTTGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798140.1
MKASRSPFPILPKLRFNIQPSCTATAASVIPSPPPTFNFKKEILDISTAAIAQSHPQLLDLAQNGTLVLLTKTQYGPVPPWRSDFVEPHGIWIIGTTHVSQESASHVERVIRAVKPENVVVELCRSRAGIMYIPENGDQNQQLRSSMFSLSGTGFFGAIGRSINLGGQTALALRLLLATFSSKVSSDINRPFGDEFRAARKVAEEIGAQLVLGDRPIEITLERAWCSLKWKEKLSLVSTIIRGMTSSVKPLEEPIGGDSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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