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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003355`

染色体: Chr03 坐标: 51866780-51873414 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003355`
名称	SmilChr03G003355
描述	rab GTPase-activating protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51866780 - 51873414 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014251`
GeneID	`131014251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014251`
原始查询	`SmilChr03G003355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rab GTPase-activating protein 22-like
产物	rab GTPase-activating protein 22-like
Arabidopsis	`AT4G28550` (AT4G28550) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828973] identity=65.1; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0810500` - identity=57.4; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0090630 (activation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC); PF23436 (RabGap-TBC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798142.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798145.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057798143.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057798144.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057798145.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51870457`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr3:51870457`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr3:51870603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:51873214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51873286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798142.1

505 aa

252

505

RabGAP-TBC

PF00566 RabGAP-TBC 212-321 aa

XP_057798143.1

499 aa

250

499

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 141-315 aa PF23436 RabGap-TBC_2 185-306 aa

XP_057798144.1

430 aa

215

430

RabGAP-TBC

PF00566 RabGAP-TBC 212-321 aa

XP_057798145.1

424 aa

212

424

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 141-315 aa PF23436 RabGap-TBC_2 185-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798142.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	212	321	5e-20	72.8	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057798143.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	141	315	2.8e-36	125.9	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057798143.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	185	306	1.2e-09	39.0	RabGAP TBC domain
`XP_057798144.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	212	321	2.9e-20	73.6	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057798145.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	141	315	1.8e-36	126.5	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057798145.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	185	306	1.2e-09	38.9	RabGAP TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942159.1
ACTAAATACGGACCCAAAAAAAAGTGGTGAACAGCAACAAACCGTAAAAAACAGTGAGCTTAATTCTCTTTGCCAAAATTATTATTACGAACAAATCCACCATTTTTCCATTCTGCATCCTTCTCGTCAATCATTCAACCCTAATCACAGTTTTTTTCAGCATTAATCATAATATTGTAAAATTCGTCTAAAAATACAACGAAACTTCTATGAGCGTCGACGTCGCCGAGCTTTCATAAGTAAATCGGTCTGCGAATTTT...

XM_057942161.1
TACGGACCCAAAAAAAAGTGGTGAACAGCAACAAACCGTAAAAAACAGTGAGCTTAATTCTCTTTGCCAAAATTATTATTACGAACAAATCCACCATTTTTCCATTCTGCATCCTTCTCGTCAATCATTCAACCCTAATCACAGTTTTTTTCAGCATTAATCATAATATTGTAAAATTCGTCTAAAAATACAACGAAACTTCTATGAGCGTCGACGTCGCCGAGCTTTCATAAGTAAATCGGTCTGCGAATTTTCGTCGT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131014251
ATGATGTTTTTCAAGACCTCTGAGGAGTTAGATTCATATTATCCTGTGAGAGCTGAATGTGCAGCTGATGTTCCCAAGACCCGGTTTAAAGCAAGGGTTGGTAAAACTCTGAGCCCAAGAAGATGGAATGCGGCATTTACTGAGGATGGCCATTTGGATATAGCTGCTGTTCTTAGAAGAATCCAGAGAGGGGGGGTTCATCCTACCATTAAAGGGGTAGTCTGGGAGTTCTTGTTAGGTTGTTTTGATCCCAACAGCAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057798142.1
MMFFKTSEELDSYYPVRAECAADVPKTRFKARVGKTLSPRRWNAAFTEDGHLDIAAVLRRIQRGGVHPTIKGVVWEFLLGCFDPNSTYDERNDIRRRRRGQYDALKAVCHNMVPTIGSGKFITTPIVTDDGHPVPDPQNSTYAISNSGQLDQREIQWMLSLPQIEVVLMLVFTHVWMSYGLIARLYSMRMKLIRQNFGMFLLSMLGWTKILGMNDICSPMVILIEHEADAFWCFERAMRRLRENFRCTTSAMGVQSQLGT...

XP_057798143.1
MMFFKTSEELDSYYPVRAECAADVPKTRFKARVGKTLSPRRWNAAFTEDGHLDIAAVLRRIQRGGVHPTIKGVVWEFLLGCFDPNSTYDERNDIRRRRRGQYDALKAVCHNMVPTIGSGKFITTPIVTDDGHPVPDPQNSTYAISNSGQLDQREIQWMLSLPQIGLDVVRTDRTLVFYENEANQAKLWDVLAVYAWMDKDIGYVQGMNDICSPMVILIEHEADAFWCFERAMRRLRENFRCTTSAMGVQSQLGTLSQIIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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