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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003357`

染色体: Chr03 坐标: 51890133-51907900 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003357`
名称	SmilChr03G003357
描述	protein TIC236, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51890133 - 51907900 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014253`
GeneID	`131014253`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014253`
原始查询	`SmilChr03G003357`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC236, chloroplastic
产物	protein TIC236%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G25660` (emb2410) embryo defective 2410 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817107] identity=62.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0179400` (SSG4) - identity=64.5; qcov=0.717; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009306 (protein secretion)
KEGG	-
Pfam	PF04357 (TamB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014253

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798147.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057798147.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798147.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798147.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51890666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:51892521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:51893130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B45,B51,B61,B77
`Chr3:51893926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51895040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C13
`Chr3:51896381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51897975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B103,B128,C49
`Chr3:51898250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C64,C66
`Chr3:51899428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C48
`Chr3:51899617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C33,C61
`Chr3:51899759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:51902478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C13,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798147.1

2228 aa

1114

2228

TamB

PF04357 TamB 1815-2125 aa

XP_057798148.1

2223 aa

1112

2223

TamB

PF04357 TamB 1810-2120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798147.1`	Pfam	`PF04357`	TamB	Repeat	1815	2125	4.4e-21	76.3	TamB C-terminal domain
`XP_057798148.1`	Pfam	`PF04357`	TamB	Repeat	1810	2120	4.3e-21	76.3	TamB C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942164.1
TTAAAATATGGCAATACAGAATCAGATTATAATACTATTATTATCTAAATTCCCAATCCCACACGCCAAAACCTAGATGAGGAATCATCAAAATTATGTGGGAGTGATTGACATCAAAATCTCAAGAAACCAGCGATAATCAACAATAGAAGAATACACAGCAACAACAGTATTGATCTGAGGAGCAATGCAACCACAAAACTTGTATTCGACATGAAAATTTATATTCGAAGTTCGTCTTCTACGAAACTTGAGGCAGG...

XM_057942165.1
TACTATTATTATCTAAATTCCCAATCCCACACGCCAAAACCTAGATGAGGAATCATCAAAATTATGTGGGAGTGATTGACATCAAAATCTCAAGAAACCAGCGATAATCAACAATAGAAGAATACACAGCAACAACAGTATTGATCTGAGGAGCAATGCAACCACAAAACTTGTATTCGACATGAAAATTTATATTCGAAGTTCGTCTTCTACGAAACTTGAGGCAGGAGCTCGGAGTTTGTTAACTACACAAACCCATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014253
ATGAGTCTTGAACTTCGTAGCCCTTTCATTGGGGTTCCACTTAATTGCACTACGTTTGAAGCGAGAAACAATCGAGATTATGCTTACCGGAGGGGAGCTGCACGAAAACCCTCCAGAAAAGGCCTATCATGTAAATGCGCTAAAAAACTTGATTTCGTCTTCTATGGTAACAAATTTAAGCACTTTTGTGGGAAAAATGCCGAGCTACTTTGGAAGAATTTGGAATTGCAGAGTGGTCGAGTGATCAATTCTGTAAGGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798147.1
MSLELRSPFIGVPLNCTTFEARNNRDYAYRRGAARKPSRKGLSCKCAKKLDFVFYGNKFKHFCGKNAELLWKNLELQSGRVINSVREPIVRNESLVKFVTPVWEEGLFLFRCSVFFSVISGVCLLVWYGQSKAKIYVEANLLPSVCTLLGDHLQRELDFGKVRRISPLSITLESCSIGPHSEEFSCGEVPTVKLRIRPFASLRRGKIVIDAVLSSPSLLVAQKKNSTWLGIPYSEGVPQRHFSAEEGIDHRTRTRRLARE...

XP_057798148.1
MSLELRSPFIGVPLNCTTFEARNNRDYAYRRGAARKPSRKGLSCKCAKKLDFVFYGNKFKHFCGKNAELLWKNLELQSGRVINSVREPIVRNESLVKFVTPVWEEGLFLFRCSVFFSVISGVCLLVWYGQSKAKIYVEANLLPSVCTLLGDHLQRELDFGKVRRISPLSITLESCSIGPHSEEFSCGEVPTVKLRIRPFASLRRGKIVIDAVLSSPSLLVAQKKNSTWLGIPYSEGVPQRHFSAEEGIDHRTRTRRLARE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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