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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003359`

染色体: Chr03 坐标: 51946788-51949197 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003359`
名称	SmilChr03G003359
描述	piriformospora indica-insensitive protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51946788 - 51949197 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014255`
GeneID	`131014255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014255`
原始查询	`SmilChr03G003359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	piriformospora indica-insensitive protein 2-like
产物	piriformospora indica-insensitive protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G28560` (RIC7) ROP-interactive CRIB motif-containing protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828974] identity=49.2; qcov=0.947; evalue=1e-135; confidence=high
Rice	`Os06g0627500` - identity=40.9; qcov=0.829; evalue=3.01e-82; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798149.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057798149.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798149.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798149.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51946955`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,B105
`Chr3:51946955`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A3,B105
`Chr3:51947204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C64,C66,D6
`Chr3:51947206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C29,C36,C39,D2
`Chr3:51947525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B24,B93,C81,C83
`Chr3:51947531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C47
`Chr3:51947556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798149.1

449 aa

224

449

LRR_8

LRR_1

PF13855 LRR_8 188-246 aa PF00560 LRR_1 212-232 aa PF00560 LRR_1 237-258 aa PF00560 LRR_1 285-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798149.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	188	246	5.5e-17	62.0	Leucine rich repeat
`XP_057798149.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	212	232	4.2e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057798149.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	237	258	4.2e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057798149.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	285	307	4.2e-24	80.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942166.1
TTCCTTGATTTCTTGCTTGTTCTCACTCCCACATTTCCACTCCATTATATACTCTCATTCTCCATATTCCTCTCATCTCTCAACCTCCATATGGCGCACTTGCGTCTCTCCCTCGCCTTTTTCTCAATTCTCGCCGCCGCCACCTTCACGCCCGCTCCCGTCCTTACGCAGTCGCCGCTCAACCCGCCCGAGCAAGAGGCTGTCTACCAGATCCTCGAGTCCGTCAGCCCCGACACCCCCTGGCGTTCCCTCTTCCCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014255
ATGGCGCACTTGCGTCTCTCCCTCGCCTTTTTCTCAATTCTCGCCGCCGCCACCTTCACGCCCGCTCCCGTCCTTACGCAGTCGCCGCTCAACCCGCCCGAGCAAGAGGCTGTCTACCAGATCCTCGAGTCCGTCAGCCCCGACACCCCCTGGCGTTCCCTCTTCCCCGACGACCTCTGCTCCTCCGCCCCTCACGGCGTCGCCTGCGACTACTTCTCCGCCGCCGCCACCCCGCACGTCACCGAGCTCAGCTTCGGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798149.1
MAHLRLSLAFFSILAAATFTPAPVLTQSPLNPPEQEAVYQILESVSPDTPWRSLFPDDLCSSAPHGVACDYFSAAATPHVTELSFGYVSDYTPNPPCNPNSILNPSLLAPLPRLRKLMFYKCFAHTQTPFPNFSVLNHTSSLEELIFIENPALTGSLHGKIGNLRRLRRLVLTGTGVSGGISDWFGGLEQLTLSRNKFSGEIPMNAFRNMKRLKVLDLSDNAFEGALPESIGYATALLKVDLSHNRFSGKIPENLSCLKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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