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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003364`

染色体: Chr03 坐标: 51988754-51991630 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003364`
名称	SmilChr03G003364
描述	long-chain-alcohol oxidase FAO2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51988754 - 51991630 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014260`
GeneID	`131014260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014260`
原始查询	`SmilChr03G003364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	long-chain-alcohol oxidase FAO2-like
产物	long-chain-alcohol oxidase FAO2-like
Arabidopsis	`AT4G28570` (AT4G28570) Long-chain fatty alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828975] identity=57.3; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0621800` (HWH1) - identity=52.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046577 (long-chain-alcohol oxidase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF00890 (FAD_binding_2); PF01494 (FAD_binding_3); PF05199 (GMC_oxred_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798155.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057798155.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057798155.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798155.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51989279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:51989451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:51989478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:51989492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,B79,C70
`Chr3:51989561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:51989736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:51989769`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr3:51989769`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr3:51990015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,C32,C58,C68,C85
`Chr3:51990052`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B31
`Chr3:51990052`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B31
`Chr3:51990128`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798155.1

742 aa

371

742

FAD_binding_3

FAD_binding_2

GMC_oxred_N

GMC_oxred_C

PF01494 FAD_binding_3 239-270 aa PF00890 FAD_binding_2 240-274 aa PF00732 GMC_oxred_N 286-503 aa PF05199 GMC_oxred_C 598-725 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798155.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	239	270	4.1e-05	23.7	FAD binding domain
`XP_057798155.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	240	274	6.1e-08	33.0	FAD binding domain
`XP_057798155.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	286	503	1.3e-75	254.7	GMC oxidoreductase
`XP_057798155.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	598	725	2e-19	71.3	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942172.1
GGAAAGTTATCCACTCTACGACATGTTAACAGAGTAAAAATATGATGGAAATATATCTCTTCCACTCTTCCATCAAAGAGACCTCGAAATTCATTTATTACATCAACCAAATCACGAGGAGGAGGTAGATGCTAACAGCTAGGGTTTGAGGAAAACACACTAATTAGCATGCAGCTACATTTATAGATTCATGCATGTGTAAAATAATATTTTCAATATTTAACGAAGACGACAAATATTTGCAAGTATATAGCTAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014260
ATGGAGGGAAGAAAGAGGAGTTTGGTGAGTGGAGGGAAGTTGGTGGTGAAGCCAAAATACAAGCATGGTTTGTCTTCCTCTCAGATTCATTCACTGAGTGCTGTGTGTGAAGCTCTAATACCGTGTATTCCTACCAATGGAAACCTAAATTCCAATGATACTAATGGAAAGCTTCTTCATCACTCCTATTACTTGTCTTCGGCTTCTCATCCTCCATTTCCTGATGAGACAGCAGAGCTGATAGTGAAGAGAGGGATACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798155.1
MEGRKRSLVSGGKLVVKPKYKHGLSSSQIHSLSAVCEALIPCIPTNGNLNSNDTNGKLLHHSYYLSSASHPPFPDETAELIVKRGIPKAVVVVSLVLKLLSTRLGTLLLCGGASLDWKWPFLHKFSELSVSKREAILQKWSRGTLLLPLRTVFFMLKLTCFYTFFSLTDEKGQNPAWESIGYHVEQVENSADSGEERPLDKGIVETENQADETTLKQSLIHKGLQVTDNTKDNTINIQCDVVIVGSGCGGGVAAAVLAEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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