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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003372`

染色体: Chr03 坐标: 52067651-52075172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003372`
名称	SmilChr03G003372
描述	phospholipid--sterol O-acyltransferase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52067651 - 52075172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014266`
GeneID	`131014266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014266`
原始查询	`SmilChr03G003372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipid--sterol O-acyltransferase
产物	phospholipid--sterol O-acyltransferase
Arabidopsis	`AT1G04010` (PSAT1) phospholipid sterol acyl transferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839335] identity=73.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0814100` - identity=60.6; qcov=0.241; evalue=6.4e-56; confidence=weak
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	-
Pfam	PF02450 (LCAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057798166.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057798166.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798166.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798166.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52068641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B122,C42
`Chr3:52069645`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:52069645`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:52070559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B71
`Chr3:52070560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B124,B134,C11
`Chr3:52070578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B35,B44,C25,C6
`Chr3:52070594`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A1,A15,A5,A6,A8,B102,B113,B119,B124,B126,B134,B25,B3,B35,B38,B41,B44,B48,B63,B71,B76,C11,C16,C19,C25,C39,C41,C43,C56,C6,C62,C63,C64,C65,C67,D5
`Chr3:52070608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B41,C62,C65
`Chr3:52071145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:52071168`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A11,A19,A22,A24,A3,B100,B104,B106,B119,B124,B129,B131,B137,B140,B15,B21,B30,B38,B42,B50,B6,B74,B83,B84,B85,B9,B92,C14,C18,C19,C21,C27,C3,C37,C4,C40,C43,C44,C50,C53,C56,C66,C69,C73,C75,C76,C77,C78,C8,C82,D4
`Chr3:52072232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:52073688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798166.1

642 aa

321

642

LCAT

PF02450 LCAT 76-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798166.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	76	510	1.3e-112	377.6	Lecithin:cholesterol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098118.1
GTACAGTCCAATCAGTCAGTCCGCCATTCAGGTCTTCAAACGCAGCGCCCAGCCAGCCAATGAGAGGACACCGCGCCACAATAATCGTCGCTTCCTTCCTCCTCCTCACCACGGCGGCGGCGGCTCCTGCTCGCGGCGGCGATGGAGCTGAAACCAACGCCGGCGATTTCAGCGGAGGACATAGCAAACTTTCTGGAATCATAATACCTGGCTTCGCGTCCACTCAGCTGAGAGCGTGGTCTATTTTGGACTGTCCGTAC...

XR_009098119.1
GTACAGTCCAATCAGTCAGTCCGCCATTCAGGTCTTCAAACGCAGCGCCCAGCCAGCCAATGAGAGGACACCGCGCCACAATAATCGTCGCTTCCTTCCTCCTCCTCACCACGGCGGCGGCGGCTCCTGCTCGCGGCGGCGATGGAGCTGAAACCAACGCCGGCGATTTCAGCGGAGGACATAGCAAACTTTCTGGAATCATAATACCTGGCTTCGCGTCCACTCAGCTGAGAGCGTGGTCTATTTTGGACTGTCCGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014266
ATGAGAGGACACCGCGCCACAATAATCGTCGCTTCCTTCCTCCTCCTCACCACGGCGGCGGCGGCTCCTGCTCGCGGCGGCGATGGAGCTGAAACCAACGCCGGCGATTTCAGCGGAGGACATAGCAAACTTTCTGGAATCATAATACCTGGCTTCGCGTCCACTCAGCTGAGAGCGTGGTCTATTTTGGACTGTCCGTACTCGCCTCTCGATTTCAATCCTCTCGATTTAGTGTGGCTCGACACCACCAAGCTTCTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798166.1
MRGHRATIIVASFLLLTTAAAAPARGGDGAETNAGDFSGGHSKLSGIIIPGFASTQLRAWSILDCPYSPLDFNPLDLVWLDTTKLLSAVNCWLKCMLLDPYNQTDNAECKSRPDSGLSAITELDPGYITGPLSSVWKEWVKWCIEFGIEANAIIAAPYDWRLSPAKLEERDLYFHRLKITFETALKLRGGPSLVFAHSLGNNVFRYFLEWLKLEIAPKDYIKWLDEHIHAYFAVGAPLLGSVETIKATLSGAAFGLPVSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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