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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003388`

染色体: Chr03 坐标: 52257807-52261126 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003388`
名称	SmilChr03G003388
描述	plasmodesmata-located protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52257807 - 52261126 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018972`
GeneID	`131018972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018972`
原始查询	`SmilChr03G003388`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasmodesmata-located protein 3-like
产物	plasmodesmata-located protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G33330` (PDLP3) plasmodesmata-located protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817896] identity=51; qcov=0.948; evalue=6.01e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0140500` - identity=51.6; qcov=0.837; evalue=1.06e-27; confidence=medium
GO	GO:0009506 (plasmodesma); GO:0010497 (plasmodesmata-mediated intercellular transport); GO:0046739 (transport of virus in multicellular host)
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057803638.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057803638.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057803638.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803638.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52258232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:52258284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C10,C13
`Chr3:52258286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52258332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B76,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803638.1

153 aa

153

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 35-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803638.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	35	128	1.3e-18	68.1	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947655.1
GTAAACATTGCCAACTGTAACGCTGGTTTCTTTAAAAGTTTTTTCACACACACACACCTCGCACTCAACTAAATTCAAACATCATCTCCCAAATTCCAAAAATTCTAGATTCCAATCTACAAAAGACCCCACAAATTCTCATCCCAGAAATCATCAAACATTCATGAAATTAATGGGACCGTCTCAGTCTCTCCTACTCCTCGCGCTCTCTCTCTTCTCCATACTCACCTCCTCCGCCGACTACTCAGCCCTCGTCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018972
ATGAAATTAATGGGACCGTCTCAGTCTCTCCTACTCCTCGCGCTCTCTCTCTTCTCCATACTCACCTCCTCCGCCGACTACTCAGCCCTCGTCTTCAAAGGCTGCGCCGACCAGAACTTCCAAAATTCCAACGCCCTTTACAGCGGAACGCTTCGAACTCTCTTCGACACGCTCATCTCCCAGTCCTCCTCCGCCAAGTTCTACAAAACCACGTCGGGCGACGGGACATCGGCCGCCGTCAGCGGCCTCTTCCAATGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803638.1
MKLMGPSQSLLLLALSLFSILTSSADYSALVFKGCADQNFQNSNALYSGTLRTLFDTLISQSSSAKFYKTTSGDGTSAAVSGLFQCRGDISGGDCNSCVQKAPNLAQKLCGQAIAARVQLNGCYLRYEISGFRQVSGVELLYKICGSNRARMG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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