当前解析结果
SmilChr03G003398| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003398 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003398 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003398 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52369776 - 52371838 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018975 |
|---|---|
| GeneID | 131018975 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018975 |
| 原始查询 | SmilChr03G003398 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018975 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803642.1 |
| 2 | Nuclear body | 核内小体 | 1.00000 | XP_057803642.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057803642.1 |
| 4 | PML body | PML body | 0.80000 | XP_057803642.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057803642.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52369802 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 27 | A19,A4,A8,B112,B123,B127,B128,B136,B17,B19,B23,B3,B37,B43,B46,B61,C27,C45,C47,C55,C61,C64,C66,C75,C8,C80,C82 |
Chr3:52369814 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B130,B58,C51,C83 |
Chr3:52369817 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B89,C61,C72,C73,C81 |
Chr3:52369821 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,C12 |
Chr3:52369833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr3:52369835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B42 |
Chr3:52369840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,B56,C83 |
Chr3:52369842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:52369849 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B6,C60,D9 |
Chr3:52369849 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B6,C60,D9 |
Chr3:52369857 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B30,C23 |
Chr3:52369862 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B136,B52,C54 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。