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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003399`

染色体: Chr03 坐标: 52375817-52378031 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003399`
名称	SmilChr03G003399
描述	protein LOW PSII ACCUMULATION 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52375817 - 52378031 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014289`
GeneID	`131014289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014289`
原始查询	`SmilChr03G003399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LOW PSII ACCUMULATION 1, chloroplastic
产物	protein LOW PSII ACCUMULATION 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G28740` (AT4G28740) LOW PSII ACCUMULATION-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828995] identity=57.2; qcov=1.08; evalue=3.77e-130; confidence=high
Rice	`Os04g0507100` - identity=66.9; qcov=0.906; evalue=1.48e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11998 (DUF3493)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798204.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057798204.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057798204.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057798204.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52375943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B28,B40,D3
`Chr3:52375957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B127,C27
`Chr3:52375990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C28,C60,C74
`Chr3:52375997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:52376081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B87
`Chr3:52376977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B48,B87,C43
`Chr3:52377118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B118,C4
`Chr3:52377794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,C26,C28,C60,C74
`Chr3:52377831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798204.1

310 aa

155

310

DUF3493

PF11998 DUF3493 58-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798204.1`	Pfam	`PF11998`	DUF3493	Family	58	134	1.1e-25	90.3	Low psii accumulation1 / Rep27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942221.1
TCCTAAAGTTATCACGTATAGTATGAAGTTGGTGGCGTGGCTCCATAGAAACAACCAGCAATCTAAATTAAGAGCCTCAGAATGTATAGTGCGACACACAGTCTGTGACAAGTGCTTGCCATGGCCGCGCTGCTGCGGCTCCCCACCCTCATATTTGATTGTCCGGGATCTTTCCCTCACCGTCACAATTTCGCCGTCACGGCTGTCGACTACTCAATACGACGCCGGAAAAGTCGATCCTCCGCCGTCACGTGCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014289
ATGGCCGCGCTGCTGCGGCTCCCCACCCTCATATTTGATTGTCCGGGATCTTTCCCTCACCGTCACAATTTCGCCGTCACGGCTGTCGACTACTCAATACGACGCCGGAAAAGTCGATCCTCCGCCGTCACGTGCTCCGCCTCCGGAGGGCCGTCTTCGTCGGAGATCAGTTCCACGGCCAAAATACGAAGCGAAGTTCTGTCTCCATTTCGCACAGTTCGAATGTTCTTTTATCTTGCTTTTATAGCTAGTGGTTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798204.1
MAALLRLPTLIFDCPGSFPHRHNFAVTAVDYSIRRRKSRSSAVTCSASGGPSSSEISSTAKIRSEVLSPFRTVRMFFYLAFIASGSLGGLIALSQLIGALANPSRAADITEILKGLGIDVGAVSTFAFLYYRENKSKNAQVARLSREEFLSNLKLRVDERRILPLSAFRGIARLVILAGPASFIQDAFKLSEPFSESLLERGILVVPFVTDGGSPKFESEEEEETKEINGKRKRLWQLEPVYAAEWSKWLDEQKKLAKIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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