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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003403`

染色体: Chr03 坐标: 52400849-52404454 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003403`
名称	SmilChr03G003403
描述	tetraspanin-18
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52400849 - 52404454 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014294`
GeneID	`131014294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014294`
原始查询	`SmilChr03G003403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-18
产物	tetraspanin-18
Arabidopsis	`AT2G20230` (AT2G20230) Tetraspanin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816542] identity=45.4; qcov=1.06; evalue=1.27e-68; confidence=high
Rice	`Os06g0731400` (B1206D04.21-1) - identity=35.7; qcov=0.953; evalue=7.61e-41; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057798209.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057798209.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057798209.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798209.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52401163`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B13,C37,C8
`Chr3:52401867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B48,B87,C43
`Chr3:52401904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:52403778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:52404028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52404034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B65,C49
`Chr3:52404048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:52404128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:52404175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C24
`Chr3:52404235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:52404245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B132,C53,C9
`Chr3:52404250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798209.1

256 aa

128

256

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 11-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798209.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	11	136	2.9e-13	50.7	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942226.1
AATCCGAAATCTTCTCTGCCTCTCTCTTTAAAAAAAATTAATAAACATAAACAACAAAAGCAAAAAGCCGAAGACTCGTTCTATTGAATTGTAGCGCACTCGAACTTCATACTCGAAAAGGAATATTTGTAGAGCAGATTACTCAAAAGTCAATTTTCCAATTCTCGAATCGCATCCTTGAAAATTTGAAGAGAATCACAAATGCGAACGCCATGTTCCCACACCTTTCTAGCATTCATCCTCAAATTCCTGAATTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014294
ATGCGAACGCCATGTTCCCACACCTTTCTAGCATTCATCCTCAAATTCCTGAATTTCCTCACCGCATTTGTGGGTGTAGTCATAATTATATACTCTGCATATGTGCTTAATCAATTGCAGCACCACCAAAACCCATTTCCTCCGCCGAATCAATCCGGATTCCGCCCTAACTCCGGCGTCTTTAACCCGGACGATGCGCTCAGCTCCAATTTCACCTCCCTCCCAGCTCCTTGGTTTACATATGCGTTTATGGGAATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798209.1
MRTPCSHTFLAFILKFLNFLTAFVGVVIIIYSAYVLNQLQHHQNPFPPPNQSGFRPNSGVFNPDDALSSNFTSLPAPWFTYAFMGIGILTCFISFIGFIGAEAISGCCLCFYAVLTTIFILSEVGLVTFIALDHQWEKDIPSDPTGEIDTLWTFIKENADVFMWVGIVIVTIQVLSVLLAIVLRSLVSSENEDDDIEGEYGFRKSTREPLLSPYSGQASGSTRGDSDIWSSRMREKYGLNTSSDTKPKFGESKSIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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