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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003408`

染色体: Chr03 坐标: 52420573-52424371 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003408`
名称	SmilChr03G003408
描述	26S proteasome regulatory subunit 4 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52420573 - 52424371 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014297`
GeneID	`131014297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014297`
原始查询	`SmilChr03G003408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome regulatory subunit 4 homolog A-like
产物	26S proteasome regulatory subunit 4 homolog A-like
Arabidopsis	`AT4G29040` (RPT2a) regulatory particle AAA-ATPase 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829025] identity=95.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0691800` (TBPOs-2) - identity=91.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0008540 (proteasome regulatory particle, base subcomplex); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0036402 (proteasome-activating activity); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00004 (AAA); PF16450 (Prot_ATP_ID_OB_C); PF17862 (AAA_lid_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798212.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057798212.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798212.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798212.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057798212.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52420830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B21,C28,C74
`Chr3:52420845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B66,C32,C68
`Chr3:52420962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B42,B43,C83
`Chr3:52421136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B48,B87,C27,C43
`Chr3:52423024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:52423600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B7,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798212.1

444 aa

222

444

Prot_ATP_ID_OB_C

AAA

AAA_lid_3

PF16450 Prot_ATP_ID_OB_C 113-167 aa PF00004 AAA 226-359 aa PF17862 AAA_lid_3 381-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798212.1`	Pfam	`PF16450`	Prot_ATP_ID_OB_C	Domain	113	167	2e-10	41.1	Proteasomal ATPase OB C-terminal domain
`XP_057798212.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	226	359	2.6e-41	141.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057798212.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	381	425	1e-11	44.8	AAA+ lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942229.1
ACTAGAATGAAAAACCCCATTTTGAATTATCAAATAATGTGGCCCTCAGTCTCAGTTTAAGTATCTCTGCATTCTTTCTTGAACAGAAAGACAAGTCCATCAATCTCTCAAACACCGTCTATTTCAAGGTCTAAACTACCCCCATCTCCACCCCCAATTTCCACCATGGGTCAGGGTACTCCCGGCGGCCTCAATCGCCAGCTCCCCGGGGACCGCAAGAATGACGGCGACAAGAAGGAGAAGAAATTCGAGCCGGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014297
ATGGGTCAGGGTACTCCCGGCGGCCTCAATCGCCAGCTCCCCGGGGACCGCAAGAATGACGGCGACAAGAAGGAGAAGAAATTCGAGCCGGCCGCGCCTCCTGCGCGCGTCGGCCGGAAGCAACGCAAGCAGAAGGGGCCTGATGCAGCGGCTCGGATACCCACGGTGACGCCGCTCACTAAGTGCAAGCTGCGTCTGCTGAAACTGGACCGAATTAAAGATTACTTGCTCATGGAAGAGGAGTTTGTGGCCAATCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798212.1
MGQGTPGGLNRQLPGDRKNDGDKKEKKFEPAAPPARVGRKQRKQKGPDAAARIPTVTPLTKCKLRLLKLDRIKDYLLMEEEFVANQERLKPQEEKTEEDRSKVDDLRGSPMSVGNLEELIDENHAIVSSSVGPEYYVGILSFVDKDQLEPGCAILMHNKVLSVVGLLQDDVDPMVSVMKVEKAPLESYADIGGLDAQIQEIKEAVELPLTHPELYEDIGIKPPKGVILYGEPGTGKTLLAKAVANSTSATFLRVVGSELI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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