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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003411`

染色体: Chr03 坐标: 52453992-52458315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003411`
名称	SmilChr03G003411
描述	protein SULFUR DEFICIENCY-INDUCED 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52453992 - 52458315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014301`
GeneID	`131014301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014301`
原始查询	`SmilChr03G003411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SULFUR DEFICIENCY-INDUCED 1-like
产物	protein SULFUR DEFICIENCY-INDUCED 1-like
Arabidopsis	`AT5G48850` (ATSDI1) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834943] identity=66.1; qcov=0.986; evalue=2.2e-138; confidence=high
Rice	`Os05g0506000` - identity=65.8; qcov=1.03; evalue=2.34e-144; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798216.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798216.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798216.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798216.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52454300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:52457527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B65,B97,C22,C54
`Chr3:52458012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798216.1

296 aa

148

296

TPR_8

PF13181 TPR_8 159-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798216.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	159	190	6.5e-06	26.6	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942233.1
AGATAAGTGGAAAACCTGCTGTTGAAATAAGTGAGATTATACAAGAACGAACCTGGACGTCCTACCGTCTGCATTCATTTACCTCTCACAATTTAGTCCACGCCCCGCCCGTATATTATTGTTGCGTATATAAATACAATGCTCAAATCTGAATACTACCTATTCTCCGTCTCAATCTGCATCTTCTCTTTTCCCAGATTCGACCAATCTATCGATCAATTCTATATATCTATACATACACTTTTTTACTAGAGAGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014301
ATGGAAAGTGGGTCGAAGAAGAAGAGTTCACAGAAGAGAGAAAGGGATCTCTTTCATGTAATTCACAAAGTTCCTTGTGGTGATGGGCCTTATGTCCGAGCAAAACATGCTCAGTTAGTTGAGAAGGATCCAGAGGGAGCTATAGTGTGGTTCTGGAAAGCAATAAATGCAGGAGATAGAGTGGAGAGCGCCCTCAAAGATATGGCTGTGGTGATGAAGCAACTCGACAGACCTCAAGAGGCAATAGAGGCCATCAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798216.1
MESGSKKKSSQKRERDLFHVIHKVPCGDGPYVRAKHAQLVEKDPEGAIVWFWKAINAGDRVESALKDMAVVMKQLDRPQEAIEAIKSFRPLCPRNSQESLDNILIDLYKKCGKVDEQIALLKHKLKLIYLGEAFNGKPTKTARSHGKKFQVSVKQETSRILGNLGWAYMQKSNFLAAEVVYRKAQMIDPDANKALNLCHCLIKQSRYDDANLVLQDVLQYKLPGSHDSKSRNRAEELSLELHIKLPNNPSSALPGFAFED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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