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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003418`

染色体: Chr03 坐标: 52527282-52529094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003418`
名称	SmilChr03G003418
描述	probable pectate lyase 8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52527282 - 52529094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014308`
GeneID	`131014308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014308`
原始查询	`SmilChr03G003418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase 8
产物	probable pectate lyase 8
Arabidopsis	`AT4G13710` (AT4G13710) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827005] identity=74.2; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0137201` (OsPLL4.2) - identity=76.3; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057798225.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798225.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798225.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798225.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52527356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:52528010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:52528032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:52528038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C48,C63,C74
`Chr3:52528041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,C18,C31,D9
`Chr3:52528044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:52528203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr3:52528318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C19
`Chr3:52528407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,C20,C23,C34
`Chr3:52528560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52528620`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr3:52528620`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798225.1

417 aa

208

417

Pectate_lyase_4

PF00544 Pectate_lyase_4 148-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798225.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	148	360	2e-25	90.3	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942242.1
CAATCAATTAATTCTTCATCGCAACCATCAATGCCCAAAATATTTGCTCTCTCGATATTTCTCACTGCACTGCTGCTCGCCAATGCAACAAGATCAGAAAATGGAAGTCAGCCCAAGCACGAAAACAACGCAGTGGATGATCCGGAGGCTGTAGCTGCCATGGTTCATATGAGTATCCAAAATAGAAGCGAGTCAAGGAAGCTTGAATCCGTCACGTGCGGGACGGGGAACCCCATCGACGACTGCTGGCGGTGCGACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014308
ATGCCCAAAATATTTGCTCTCTCGATATTTCTCACTGCACTGCTGCTCGCCAATGCAACAAGATCAGAAAATGGAAGTCAGCCCAAGCACGAAAACAACGCAGTGGATGATCCGGAGGCTGTAGCTGCCATGGTTCATATGAGTATCCAAAATAGAAGCGAGTCAAGGAAGCTTGAATCCGTCACGTGCGGGACGGGGAACCCCATCGACGACTGCTGGCGGTGCGACCCGAACTGGATCCGCAACCGCCGACGCCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798225.1
MPKIFALSIFLTALLLANATRSENGSQPKHENNAVDDPEAVAAMVHMSIQNRSESRKLESVTCGTGNPIDDCWRCDPNWIRNRRRLADCAIGFGRNSVGGRDGRYYVVTDPSDEDAVNPRPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELLVNSFKTIDGRGANVHIANGACITIQHVTNVIVHGLSIHDCKPTGNALVRSSPSHSGWRGMADGDGISIFASSHVWIDHNSLASCSDGLIDAIMGSTAITISNNYFSHHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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