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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003423`

染色体: Chr03 坐标: 52555801-52557613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003423`
名称	SmilChr03G003423
描述	probable pectate lyase 8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52555801 - 52557613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014312`
GeneID	`131014312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014312`
原始查询	`SmilChr03G003423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase 8
产物	probable pectate lyase 8
Arabidopsis	`AT4G13710` (AT4G13710) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827005] identity=74.2; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0137201` (OsPLL4.2) - identity=76; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057798229.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798229.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798229.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798229.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52555879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52556422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C40,C70,C9
`Chr3:52556425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B4,C75
`Chr3:52556710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B62,C63
`Chr3:52556863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D11
`Chr3:52557047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:52557067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B106,B49,C76
`Chr3:52557220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B31,C1
`Chr3:52557304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798229.1

417 aa

208

417

Pectate_lyase_4

PF00544 Pectate_lyase_4 148-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798229.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	148	360	2.2e-25	90.2	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942246.1
TTAATTCACCATCTCTACATTCATTTCTACCAATCAATTAATTCTTCACCTCGCAACCATCAATGGCCAAAATATTTGCTCTCTCCATATTTCTCACTGCACTGCTGCTCGCCAATGCAACAAGATCAGAAAATGGAAGTGAGCCCAAGCACGAAAACAACGCAGTGGATGATCCGGAGGCTGTAGCTGCCATGGTTCATATGAGTATCCAAAATAGAAGCGAGTCAAGGAAGCTTGAATCCGTCACGTGCGGGACGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014312
ATGGCCAAAATATTTGCTCTCTCCATATTTCTCACTGCACTGCTGCTCGCCAATGCAACAAGATCAGAAAATGGAAGTGAGCCCAAGCACGAAAACAACGCAGTGGATGATCCGGAGGCTGTAGCTGCCATGGTTCATATGAGTATCCAAAATAGAAGCGAGTCAAGGAAGCTTGAATCCGTCACGTGCGGGACGGGGAACCCCATCGACGACTGCTGGCGGTGCGACCCGAACTGGATCCGCAACCGCCGACGCCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798229.1
MAKIFALSIFLTALLLANATRSENGSEPKHENNAVDDPEAVAAMVHMSIQNRSESRKLESVTCGTGNPIDDCWRCDPNWIRNRRRLADCAIGFGRSSVGGRDGRYYVVTDPSDEDAVNPRPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELLVNSFKTIDGRGANVHIANGACITIQHVTNVIVHGLSIHDCKPTGNALVRSSPSHSGWRGMADGDGISIFASSHVWIDHNSLASCSDGLIDAIMGSTAITISNNYFSHHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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