当前解析结果
SmilChr03G003429| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003429 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003429 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003429 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52629822 - 52630371 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018980 |
|---|---|
| GeneID | 131018980 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018980 |
| 原始查询 | SmilChr03G003429 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018980 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803648.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057803648.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.60000 | XP_057803648.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803648.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803648.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52629871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,C65,C78 |
Chr3:52629877 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:52629918 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B122 |
Chr3:52629918 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:52629922 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B122 |
Chr3:52629922 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:52629936 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,C53,C78 |
Chr3:52629972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B41 |
Chr3:52629975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B79,C58 |
Chr3:52630069 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr3:52630078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr3:52630106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B55,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。