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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003430`

染色体: Chr03 坐标: 52640735-52645165 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003430`
名称	SmilChr03G003430
描述	uncharacterized SmilChr03G003430
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52640735 - 52645165 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014320`
GeneID	`131014320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014320`
原始查询	`SmilChr03G003430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831135]; symbol=AT5G12950; hit=AT5G12950; species=arabidopsis; confidence=high
产物	proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831135]; symbol=AT5G12950; hit=AT5G12950; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12950` (AT5G12950) proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831135] identity=63.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0195500` - identity=59.9; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046373 (L-arabinose metabolic process); GO:0046556 (alpha-L-arabinofuranosidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07944 (Beta-AFase-like_GH127_cat); PF20736 (Glyco_hydro127M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057798233.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057798233.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798233.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798233.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52641431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:52641597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D11
`Chr3:52641602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A2,B3
`Chr3:52641857`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B96,B98,C60
`Chr3:52641857`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B96,B98,C60
`Chr3:52641858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr3:52641880`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C39,C54,C78
`Chr3:52641880`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C39,C54,C78
`Chr3:52642052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:52642075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:52642172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B3
`Chr3:52642216`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	163	A1,A10,A18,A19,A22,A23,A25,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B102,B103,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B133,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B50,B53,B56,B59,B60,B62,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B73,B75,B78,B80,B81,B82,B84,B85,B87,B90,B92,B94,B96,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C21,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798233.1

861 aa

430

861

Beta-AFase-like_GH127_cat

Glyco_hydro127M

PF07944 Beta-AFase-like_GH127_cat 110-492 aa PF20736 Glyco_hydro127M 505-607 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798233.1`	Pfam	`PF07944`	Beta-AFase-like_GH127_cat	Repeat	110	492	3.4e-116	389.1	Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 catalytic domain
`XP_057798233.1`	Pfam	`PF20736`	Glyco_hydro127M	Domain	505	607	1.1e-16	61.4	Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942250.1
GAGATTGACACTCTTGTAGTAAAATATACTCTTGAAGACAATGACATCCCATCCGCGATCCTTCTTTAGCAAAATTCCAACTCTCTCTGTCTCTCTCAATATGTATAAGATTGCAAGTTCACCTTGCTGTACGCAATTAATCTCGTACCGGTTTCAATATAAACCGAGCAATAATGTAATAAATAAATATCTTATGATTTTCCTAACAAAAGACCTTTCTTAGTTGTAGTAGGTGTGCATAAATCTGAGTATTAGTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014320
ATGAAGAATTCATTGATGCTTGCTAAACTGTTACCGACGATGCTTGTACTGCAACTATGCGGATACGTCGTGTGCAAAGAGTGCACCAACACTCCAACTCAATCGCACACTCTGAGATACCAGCTGCTGACATCCAAGAACGAGACGTGGAAACACGAGGTGCTCTCACACGACCATCACCTCACGCCCACCGATGATGCCGTGTGGTCGAGCTTGTTTCCCAGGAAGATGCTGCGAGAGGAGGACGAGCACACTTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798233.1
MKNSLMLAKLLPTMLVLQLCGYVVCKECTNTPTQSHTLRYQLLTSKNETWKHEVLSHDHHLTPTDDAVWSSLFPRKMLREEDEHTWAMMYRKIKNSGGAKGLLNEVSLHDVRLDPNSLHGKAQQTNLDYLLILDVDSLLWSFRKTAGLDAPGKPYGGWESPDMELRGHFVGHYLSACAQMWASTHNESLKQKMDAVVSALSACQQKMGTGYLSAFPSEFFDRFEAIKYVWAPYYTIHKILAGLLDQYTLGCNEQALKMAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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