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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003436`

染色体: Chr03 坐标: 52717614-52726291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003436`
名称	SmilChr03G003436
描述	uncharacterized SmilChr03G003436
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52717614 - 52726291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014325`
GeneID	`131014325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014325`
原始查询	`SmilChr03G003436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831136]; symbol=AT5G12960; hit=AT5G12960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831136]; symbol=AT5G12960; hit=AT5G12960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12960` (AT5G12960) proline-tRNA ligase (DUF1680) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831136] identity=60.7; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0195500` - identity=57.5; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046373 (L-arabinose metabolic process); GO:0046556 (alpha-L-arabinofuranosidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07944 (Beta-AFase-like_GH127_cat); PF20736 (Glyco_hydro127M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057798241.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057798241.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798241.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798241.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52718184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B53,B77,B8
`Chr3:52718319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B118,B31,B69,C1
`Chr3:52718507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:52719193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52719564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:52720581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:52723760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52724012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B98
`Chr3:52724459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:52724551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:52724577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:52725058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798241.1

862 aa

431

862

Beta-AFase-like_GH127_cat

Glyco_hydro127M

PF07944 Beta-AFase-like_GH127_cat 108-490 aa PF20736 Glyco_hydro127M 503-604 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798241.1`	Pfam	`PF07944`	Beta-AFase-like_GH127_cat	Repeat	108	490	1.1e-114	384.0	Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 catalytic domain
`XP_057798241.1`	Pfam	`PF20736`	Glyco_hydro127M	Domain	503	604	6.8e-17	62.1	Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942258.1
CATCTGAAACCAAAACGGGCCATAAATTATTGGGAGTCGCTGGTGGTCTCTGTAGAGGCTTTTCAAGAATCGCACTAAATTCTCCTCTGCTTCTCTCTCTTAATCGTTCTCTATCGCAAACTTTTCATATGTGGCTATGCGCATGATTTTGTTGCGTGTTCTTCAGTATTACATCTCGGTGTTTGGCGTTACATCCAATTACGTATAATTTATTGCTGAATTTGTGAAGATGTTGGGAGGTCTGATTGTATTTTCGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014325
ATGTTGGGAGGTCTGATTGTATTTTCGCTGTTTTTCGGTTTCACTTTGAGCCATAAGCTTTGCACTAATGGTGGTTTGCTATCGCACACCGCTCGCCATCAACGGTTTTTATCAAACAATTCATCGTGGGAAAAACAAAATCTTGCTGATTTGCATTTGATTCCCACCGATGATCAGACATGGTCTAACTTGATTCCGAGGAAAATGCTTTTAGCAGGCGATGAGATTAGCTGGAATGTAATGTATAGAAAAATGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798241.1
MLGGLIVFSLFFGFTLSHKLCTNGGLLSHTARHQRFLSNNSSWEKQNLADLHLIPTDDQTWSNLIPRKMLLAGDEISWNVMYRKMKNAGGESGRESGGGFLREISLHDVRLEPKSVHGVAQQTNLEYLLMLDVDRLVWSFRRTAGLEAPGEPYGGWEAPNVELRGHFVGHYLSASAQMWASTHNGDLQEKMSSVVSALSDCQNKIGTGYLSGFPSELFDRFETLQEVWAPYYTIHKILTGLLDQYTMADSARALEMMKWM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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