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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003463`

染色体: Chr03 坐标: 53044200-53049585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003463`
名称	SmilChr03G003463
描述	pectin acetylesterase 12
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53044200 - 53049585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014350`
GeneID	`131014350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014350`
原始查询	`SmilChr03G003463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 12
产物	pectin acetylesterase 12
Arabidopsis	`AT3G05910` (AT3G05910) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819760] identity=74.4; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0634600` (P0455H11.118-1) - identity=66.4; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057798275.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057798277.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057798275.1`
4	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057798277.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53045058`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr3:53045058`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr3:53047461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B117,B53,B8
`Chr3:53048748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B100,B48,B75,C48
`Chr3:53048957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B129,B59
`Chr3:53048957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B59
`Chr3:53049079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:53049088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:53049351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798275.1

429 aa

214

429

PAE

PF03283 PAE 63-424 aa

XP_057798276.1

429 aa

214

429

PAE

PF03283 PAE 63-424 aa

XP_057798277.1

359 aa

180

359

PAE

PF03283 PAE 10-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798275.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	63	424	6.5e-174	579.0	Pectinacetylesterase
`XP_057798276.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	63	424	6.5e-174	579.0	Pectinacetylesterase
`XP_057798277.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	10	354	4e-167	556.6	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942293.1
CATACAATTCCAACGCAATACTCTATTCATGTATCGTTTTTCTAAAATTGCCACCTTCCAATGCAAAACTTTTACCACGTAAAATTGTTGGTAGACTTACCTTGTAAAATTGTGAAGTCATTTCGCAGCGCTGTAGCTTTATAAGATTCTAAACGTAACCCCATTTTTATTCCTTTGTTTATCACCCTTTTTTTTATGTATGGAACATAGTATATAGATACATATATTATATACTCCATTTATCTAACCTCAGAAATAGC...

XM_057942292.1
TTTGTTTATCACCCTTTTTTTTATGTATGGAACATAGTATATAGATACATATATTATATACTCCATTTATCTAACCTCAGAAATAGCCGGCAAAAACATCGCTCCGCTGTTCACTTCTTTAAAGCATTAATCACTGCTCTACTTGGATAGTTGGATCTCCTAATTTCTGCTGTGTAGAACCCACTTAAAAGAGAAAGAAAAAATTAAAAAATAAGAAGAAGAAGCCCCACCTTCCTTCTTGACCCCAAGAAAAATCTACA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014350
ATGGGGAAGCTGGTGGAGATTGGAGCTGTGTTTTGTGTTTTGTTTGTTTTGAGTAAATGGGGAGCTGAAAGTTTGGAACTTGATGCCTTGTTCAGTGGGAATAGCAGCTCAGATGTGTCATTCTTGGAGTCTATGTCGCATTTGGAGTCTGTTTATGGAGTTGCTGCTGCAGCTGTTCCTCCCGATGCTCTCATGGTGGGTCTCACTCTTGTTCAGGGAGCTGCTGCTAAAGGGGCTGTATGTTTGGACGGAACGATACC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798275.1
MGKLVEIGAVFCVLFVLSKWGAESLELDALFSGNSSSDVSFLESMSHLESVYGVAAAAVPPDALMVGLTLVQGAAAKGAVCLDGTIPGYHLHRGFGTGANSWLIQLEGGGWCNNLRSCIYRKKTHRGSSTLFEKQIPFTGLLSNKAEDNPDFFNWNRVKIRYCDGASFAGDSENKAAGLHFRGQRIWRAAIEDLMSKGMHNANQALLSGCSAGGLASILHCDEFRSLFPGSTKVKCLSDAGLFMDAADVSGGRTMRSFFG...

XP_057798276.1
MGKLVEIGAVFCVLFVLSKWGAESLELDALFSGNSSSDVSFLESMSHLESVYGVAAAAVPPDALMVGLTLVQGAAAKGAVCLDGTIPGYHLHRGFGTGANSWLIQLEGGGWCNNLRSCIYRKKTHRGSSTLFEKQIPFTGLLSNKAEDNPDFFNWNRVKIRYCDGASFAGDSENKAAGLHFRGQRIWRAAIEDLMSKGMHNANQALLSGCSAGGLASILHCDEFRSLFPGSTKVKCLSDAGLFMDAADVSGGRTMRSFFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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