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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003477`

染色体: Chr03 坐标: 53310854-53316655 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003477`
名称	SmilChr03G003477
描述	uncharacterized SmilChr03G003477
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53310854 - 53316655 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014365`
GeneID	`131014365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014365`
原始查询	`SmilChr03G003477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819643]; symbol=AT3G04830; hit=AT3G04830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819643]; symbol=AT3G04830; hit=AT3G04830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G04830` (AT3G04830) Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819643] identity=75.6; qcov=1; evalue=2.74e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0127000` - identity=64.8; qcov=0.97; evalue=3.55e-141; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0034975 (protein folding in endoplasmic reticulum); GO:0072546 (EMC complex)
KEGG	-
Pfam	PF22890 (TPR_EMC2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798304.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798304.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798304.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798304.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53312402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C72
`Chr3:53316332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798304.1

302 aa

151

302

TPR_EMC2

PF22890 TPR_EMC2 100-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798304.1`	Pfam	`PF22890`	TPR_EMC2	Repeat	100	209	2.3e-55	187.5	EMC2 TPR-like repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942321.1
ACAGAGTTGAAAATTATTATGGGCTCTCCAATTTGTAGGGTTGTATATAATAGATTCCCAGTTTGAAGATGCAATGGACTAGTGAAAAGTGTAAAATATTGTATTTATGTATTACTACTAATTACTAATTATTTTAAAAATATGCATTAGGTAAAGATTGACGAAATAGATTTTGAGGATATAGGAGATAAAATTGATAGACCGGTGAAGGAATTCTAGTTATATTCAATCAACCAAAGATTTAATAGCAAAAGCAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014365
ATGGTGAGCAAAACAGAGGAAGAGCAGCTGATTAGATTGGAGAACCAAGTGGAGAACGGCGGTGGCGGCGCGTGGGAGTACCTCTGCCTCGTCAGGAAGCTCAAGCTCCGTCGCTCCGACAAAGTCTTCAAGTACGGCTCCACCATCCTCAGCGACCCTAAGAAGCGATCTGCACTTGGCCCAGAAGAGTGGACTTTATATGAGCAAGTTGCTATTGCTGCAATGGACTGCCAGCGTCTTGATGTGGCTAAGGAGTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798304.1
MVSKTEEEQLIRLENQVENGGGGAWEYLCLVRKLKLRRSDKVFKYGSTILSDPKKRSALGPEEWTLYEQVAIAAMDCQRLDVAKEYIKVLQGKFRESKRVGRLEAMLLEAKGLWAEAEKAYSSLLEDNQFDQVIHKRRVAMAKAQGNLSGAIEWLNKYLDIFMADHDAWRELAEIYVSLQMYKQAAFCYEELLLSHPTIPLYHLSYADVLYTLGGVENLHAAKKYYAATIDLTGGKNTRALFGICLCASAIAQLTRGRNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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