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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003488`

染色体: Chr03 坐标: 53449421-53456826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003488`
名称	SmilChr03G003488
描述	uncharacterized SmilChr03G003488
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53449421 - 53456826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014377`
GeneID	`131014377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014377`
原始查询	`SmilChr03G003488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825132]; symbol=AT3G59630; hit=AT3G59630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825132]; symbol=AT3G59630; hit=AT3G59630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G59630` (AT3G59630) diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825132] identity=58.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0265600` - identity=53.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0017183 (protein histidyl modification to diphthamide); GO:0090560 (2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01866 (Diphthamide_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798319.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798319.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798319.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798319.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53450201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C22
`Chr3:53451800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:53451999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C57
`Chr3:53452006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B17,C87,D10
`Chr3:53454748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B136,B21,C28,C74
`Chr3:53456488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798319.1

487 aa

244

487

Diphthamide_syn

PF01866 Diphthamide_syn 28-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798319.1`	Pfam	`PF01866`	Diphthamide_syn	Family	28	371	7e-80	269.3	Putative diphthamide synthesis protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942336.1
GGACGGAGGGAGTATTATTTAGGAGAGAGCTGATTAAGCCCTTGCTACTTCTCCTCTCATCTTCTTTAGCACCGCCGACCATCACCATCCCGCCACTGACCGAACCACCGTCAACCCCATTTAGCTTCTTTGACACGAATTCGATGATTTCTGGACCTAATTTTGGAAGGAAAGTTTGAATCTTTCTTCTTCTAAAGGGTTGCTGCGATTAGTCTTCTTTTAATTTTCCCTCAAAATATTCTGGGCATGGAGTTGGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014377
ATGGAGTTGGACTGTAATTACGAAATAGCCCGAGTAGCGGAGTTCGTCTGTAGTGGTGGCTTCACTAGAGTAGCTCTGCAGTTCCCGGATGAGCTATTGAAGGATTCTATGAAGGTGGTTAAAGCTCTGCGCCGGGAACTCAATTCATCAGTGAAGTTGTACGTAATGGCTGACACTACATACGGAAGCTGCTGCGTCGATGAAGTTGGGGCTGCACATATTGGTGCCGAATGCGTCATTCATTATGGCCAAACATGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798319.1
MELDCNYEIARVAEFVCSGGFTRVALQFPDELLKDSMKVVKALRRELNSSVKLYVMADTTYGSCCVDEVGAAHIGAECVIHYGQTCLSSTSTIPALFIFDKASISPSNCARSLLDHGLKSGKPVLVLSGLEFAHAIPEIKKAVASAASSISGSTSMLELLYADLCCSVVSPSETCTSVNQIGVGGQVVHQCPADESGQTYSTGGLSWRLPQGQKMEDYLLFWIGLDNPAFANVVLTFNNCEIVRYDATEGRLVTDVSQQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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