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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003494`

染色体: Chr03 坐标: 53508101-53513507 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003494`
名称	SmilChr03G003494
描述	uncharacterized SmilChr03G003494
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53508101 - 53513507 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014383`
GeneID	`131014383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014383`
原始查询	`SmilChr03G003494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819623]; symbol=AT3G04650; hit=AT3G04650; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819623]; symbol=AT3G04650; hit=AT3G04650; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G04650` (AT3G04650) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819623] identity=65.5; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0597400` - identity=66; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798326.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057798326.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798326.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798326.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53508814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:53509776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:53510681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:53511003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr3:53511438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:53512151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:53512196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:53512361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:53513110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B58,C31
`Chr3:53513182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B91,C16,D7
`Chr3:53513194`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr3:53513194`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798326.1

471 aa

236

471

NAD_binding_8

PF13450 NAD_binding_8 75-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798326.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	75	141	2.2e-13	51.0	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098187.1
GAAATTGATGGAACCATTAGAATCGACTGAACAACATGAAAAACTTAGAATTAGATTTTAATCTTTTGAATAATTAAAACGCGAAAATGATGCCGTTTTGATTATTCAAAATTTAAATAAAAGAATTAATAGTTTCCATCTCCATCATGTTTAGATACTGGAGATGCAGCAGCCCAGCCTGGTTAACGCAAAAGAAGAAAAACCCACTGAGATTATCATCCTCTTCCACAGGCTAGGCAATGACCTTACTGTCTCGTTCC...

XR_009098188.1
ACATGAAAAACTTAGAATTAGATTTTAATCTTTTGAATAATTAAAACGCGAAAATGATGCCGTTTTGATTATTCAAAATTTAAATAAAAGAATTAATAGTTTCCATCTCCATCATGTTTAGATACTGGAGATGCAGCAGCCCAGCCTGGTTAACGCAAAAGAAGAAAAACCCACTGAGATTATCATCCTCTTCCACAGGCTAGGCAATGACCTTACTGTCTCGTTCCATCACTCTCACTCCTTTCCCCTCTTTTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014383
ATGACCTTACTGTCTCGTTCCATCACTCTCACTCCTTTCCCCTCTTTTCTCTCTCCAAAACCCAGCTCGCCACGAAACCTAATCTACTGCAAGAATGACGAAATGAACAGCTCAAGAAAGAAACCTTCTTATGGCGCCTCCAGGCGCTCTGTTCTCAAGAAAAGCTTCACTCAGGAACAGGTGGACTTCACGGTTCCGATTTCGACCGACCCCGTTGTTGGAATTATTGGTGGTGGTATGTCGGGGCTTCTCTGTGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798326.1
MTLLSRSITLTPFPSFLSPKPSSPRNLIYCKNDEMNSSRKKPSYGASRRSVLKKSFTQEQVDFTVPISTDPVVGIIGGGMSGLLCALYLDKRGIKSTVFDTGIHGLGGRMGTRTVDPEHLTFDHAAQFFTASDPNFVEMVDLWSKNGLVRQWDGPIGELESGGRFSPLPPSPPRYIGVNGMRPLAESILSETSIVNVVRPCWVSKLEPYNGKWYLSENGKPCGHFDVIVIAHNGKCANRLLASSGLPLIARQMKRLDLSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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