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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003501`

染色体: Chr03 坐标: 53636771-53643349 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003501`
名称	SmilChr03G003501
描述	flowering locus K homology domain
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53636771 - 53643349 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014390`
GeneID	`131014390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014390`
原始查询	`SmilChr03G003501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flowering locus K homology domain
产物	flowering locus K homology domain
Arabidopsis	`AT3G04610` (FLK) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819619] identity=59.8; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0627500` - identity=53.7; qcov=0.929; evalue=6.5e-150; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798332.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057798332.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057798332.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798332.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53638783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B91,C16,D7
`Chr3:53639071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:53639086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B133,B59,C13,C37
`Chr3:53640085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:53640908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B133,B59
`Chr3:53640941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C37
`Chr3:53641104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:53642087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,C28,C38,C46,C74
`Chr3:53642972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:53642973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:53643039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:53643053`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798332.1

533 aa

266

533

KH_1

PF00013 KH_1 143-195 aa PF00013 KH_1 235-302 aa PF00013 KH_1 413-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798332.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	143	195	1.9e-45	153.2	KH domain
`XP_057798332.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	235	302	1.9e-45	153.2	KH domain
`XP_057798332.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	413	476	1.9e-45	153.2	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942349.1
TTTTGGCACATCTACATCGAAGAGAGCCACCTTTCAAAACGCATACAGTATTTAGTTGGGAAATTTGTTTTTAAACACACAAACACAAATACTCCATATATTTTGGATTTGTATACCCTTTTATTATTAAATTAAATGCATAAAATTGCTTCCTCCCTTCCCGGCCTCCCCTCCCGGCCCCAAACAAAGGATGCACAAAAATCCTTTTATATTTTGTCTTAGAGCGAGCTCAACAAATGACCCCAAAAACCTAAGTAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014390
ATGGAGGAAATTGATCAGAATCCTACTGAACTTGAACAACATGAACATGAATATCAGCCTAACAACGGAATTGAAAATGAACTTGAATACCAGCCTGACACTGAACAGGAATACCAGCCCGACAATGGACAGGAATACCAGCCTGATGGAAAGCATGAGTACCAGCCTGAGAACGAACATGAATACCAACCCGAGAATGAGCCTGGATACCAGCCTGAAAATGATCAAGAATATCAACCTGAAACCGAACATGAGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798332.1
MEEIDQNPTELEQHEHEYQPNNGIENELEYQPDTEQEYQPDNGQEYQPDGKHEYQPENEHEYQPENEPGYQPENDQEYQPETEHENEQEFVHEFAQVPEQEDKHEIEDEIPENLRPDEEKNLTNETVDGGGDRWPGWPGESVFRMLVPAQKVGSIIGRKGEYIKKTCEETKARIKILDGPPGTRERAVMVSAKEEPNSPLPPAVDGLLRVHKRVVDGLDNDSTHPPAGAVGKVSTRLLVPAAQAGSLIGKQGTTVKSIQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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