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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003503`

染色体: Chr03 坐标: 53645604-53647041 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003503`
名称	SmilChr03G003503
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53645604 - 53647041 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014392`
GeneID	`131014392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014392`
原始查询	`SmilChr03G003503`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2
产物	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2
Arabidopsis	`AT5G04890` (RTM2) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830370] identity=47.1; qcov=0.276; evalue=6.28e-22; confidence=weak
Rice	`Os05g0592000` - identity=30; qcov=0.378; evalue=1.56e-13; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057798336.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057798336.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057798336.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798336.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53645695`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B102
`Chr3:53645695`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B102
`Chr3:53645764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:53645961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C57
`Chr3:53645974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:53646047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:53646091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:53646290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B91,C16,D7
`Chr3:53646501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:53646558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:53646561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B133,B59
`Chr3:53646630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798336.1

370 aa

185

370

HSP20

PF00011 HSP20 35-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798336.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	35	117	8.9e-10	39.3	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942353.1
AACACACACATTGCTGTTATATAACAGATTTACCACATTGAGAAAAAACTAGTTGCAGAGCAAATGGTGATGAGGTCGAGAGGCGGCGGCGGTGCCGGTTCTAGACGGACAACAAGATCAGGGGTCGTCCGATCAGTCTACGAAGATTTCAAGCCGGTATCTGAATGGCAGCAAGATGATGAATCCCACATTCTCAATATTTATCTTCCTGGTTTCATGAAGGAGCAGATCAAGGTTAGCATGGAAGGCCGGAACACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014392
ATGGTGATGAGGTCGAGAGGCGGCGGCGGTGCCGGTTCTAGACGGACAACAAGATCAGGGGTCGTCCGATCAGTCTACGAAGATTTCAAGCCGGTATCTGAATGGCAGCAAGATGATGAATCCCACATTCTCAATATTTATCTTCCTGGTTTCATGAAGGAGCAGATCAAGGTTAGCATGGAAGGCCGGAACACCATCAGGGTTCGCGGGGAACGCCTTGTAGCTGGCAACAAATGGAGTCGCTTCCTGGAGGACTTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798336.1
MVMRSRGGGGAGSRRTTRSGVVRSVYEDFKPVSEWQQDDESHILNIYLPGFMKEQIKVSMEGRNTIRVRGERLVAGNKWSRFLEDFQVPENGEMNSARAKFRGGILSITVPREKVGKEDALPTETRGVDDIRKQPTPQKLSGDPEMKRGQDGNQKQPIPQHEASPAVGTSQSAEEKRLEPLKASAEHNHRHDLELTSTRNVVSQDIEKKESSDKSLLDPKNAHDRDGDQKGRSFTPMRITGNVITQNDVRIESSETKEKH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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