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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003512`

染色体: Chr03 坐标: 53721573-53727519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003512`
名称	SmilChr03G003512
描述	phospholipid-transporting ATPase 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53721573 - 53727519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014400`
GeneID	`131014400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014400`
原始查询	`SmilChr03G003512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipid-transporting ATPase 1
产物	phospholipid-transporting ATPase 1
Arabidopsis	`AT5G04930` (ALA1) aminophospholipid ATPase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830375] identity=69; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0277600` (osALA2) - identity=66.1; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0045332 (phospholipid translocation); GO:0140326 (ATPase-coupled intramembrane lipid carrier activity)
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13246 (Cation_ATPase); PF16209 (PhoLip_ATPase_N); PF16212 (PhoLip_ATPase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798338.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057798338.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057798338.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057798338.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057798338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53723800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B9,C2,C36
`Chr3:53723956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:53725558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B9,C2,C36
`Chr3:53725611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B49,C49
`Chr3:53725687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:53725796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B9,C2,C36
`Chr3:53726015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,D4
`Chr3:53726027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B133,B59,B99
`Chr3:53726170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798338.1

1241 aa

620

1241

PhoLip_ATPase_N

Cation_ATPase

PhoLip_ATPase_C

PF16209 PhoLip_ATPase_N 135-202 aa PF13246 Cation_ATPase 597-792 aa PF16212 PhoLip_ATPase_C 965-1205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798338.1`	Pfam	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	Family	135	202	7.8e-26	90.3	Phospholipid-translocating ATPase N-terminal
`XP_057798338.1`	Pfam	`PF13246`	Cation_ATPase	Family	597	792	8.2e-16	59.0	P-type ATPase, cytoplasmic domain N
`XP_057798338.1`	Pfam	`PF16212`	PhoLip_ATPase_C	Family	965	1205	1.5e-71	241.9	Phospholipid-translocating P-type ATPase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942355.1
CTTACATCTGCCGTCAATTCTAAGACCAAATAAAATTCAAAAATCCCATTATAAATTTGTTTTAGATAATAATCAAGAACCTTCGATTCAACCATTGCCACCTCGCCACCTATTTGCGACTCTTCTTCTTTCATGACATTATTTTCCTTTTCCCAGTTTCTTGCAATCTTCGTTTATTATTTTTTAATTTTTGTTAAAAGGAAAATAAATTATTTGACCTTTGAATTTTCTCCCTCCTTCCTCAGAGACATAATCAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014400
ATGAAGGCCTCCCAACAGCGGCCTTTGCTGATTCCTTCACCTCGAACACCGGGTAAAGAAGAGCTCCCTTACACTCCTATTGCTATTGATAGTTCAATTCCTGTTTCTTCTATGTCAAAACCTTATTCAGATTCCCAGATTGAAATGAGTGGAACCTCTAATAAAGTTGCTGATTTTGTGAGGAACCCTTCCTCCCAATCCATTCAGTCAAAGTCCTCTAGCGGCCACTCCATTAAGGAGGTGAACTTTAGAGAAGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798338.1
MKASQQRPLLIPSPRTPGKEELPYTPIAIDSSIPVSSMSKPYSDSQIEMSGTSNKVADFVRNPSSQSIQSKSSSGHSIKEVNFREGHEPNPNPVRYGSRGASSDSNPVRYGSRGASSGGFSTSFKEIKDEDARLVYVNDPGRTNEKRFKFAGNSIRTSKYSILTFLPRNLFEQFHRIAYIYFLVIAILNQLPQLAVFGREASILPLAMVLFVTAVKDAYEDYRRHRSDRIENNRLASVLVNGEFEDKKWKDICVGEVIKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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