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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003520`

染色体: Chr03 坐标: 53805883-53809087 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003520`
名称	SmilChr03G003520
描述	ALA-interacting subunit 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53805883 - 53809087 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014408`
GeneID	`131014408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014408`
原始查询	`SmilChr03G003520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ALA-interacting subunit 3-like
产物	ALA-interacting subunit 3-like
Arabidopsis	`AT1G54320` (AT1G54320) LEM3 (ligand-effect modulator 3) family protein / CDC50 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841873] identity=67; qcov=0.991; evalue=4.68e-120; confidence=high
Rice	`Os06g0665000` - identity=67; qcov=0.991; evalue=8.22e-119; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03381 (CDC50)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057798349.1`
2	Endosome	内体	0.40000	`XP_057798349.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057798350.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057798349.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057798350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53806596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:53806660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:53806722`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,A25,B105,B53,B66,C63,C68,C87,D3
`Chr3:53806728`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A15,A25,B105,B53,B66,C63,C68,D3
`Chr3:53806730`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A15,A25,B105,B53,B66,C63,C68,D3
`Chr3:53808005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C2,C36
`Chr3:53808006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:53808437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr3:53808715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798349.1

348 aa

174

348

CDC50

PF03381 CDC50 59-330 aa

XP_057798350.1

235 aa

118

235

CDC50

PF03381 CDC50 1-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798349.1`	Pfam	`PF03381`	CDC50	Family	59	330	6.9e-89	298.8	LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family
`XP_057798350.1`	Pfam	`PF03381`	CDC50	Family	1	217	1.1e-80	271.9	LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942366.1
AACTAATTGAATTATTTTTCTTTGGCTAAACCACTTCAATTGTTTTCTTTAATTTTATCACTTTAATTTGTTTAAAAACTGCATTTCTTGGCATTCTTGCTCTGCCTACTTCTACGATTAACTTTATTTTTCACAATCACTCAATTTTATTTTGAAACCTTCTTTATCAAATTTTAATGCGCAATCCACGTAATTAGTGAGTTAAAAACGACAAAATTCCTTTCCAAAACCACAAAACATGACAAAGAATTATCCCTTTT...

XM_057942367.1
GTTGTTGAACTCGTGGACCAGTACGACGAGGTCTGCATTCCTGCGGATTCTTCGGATCGTGATGCTGCATATAAGAAGAGGATAGGATACATCCAAGATGATAAGACGGACAAAACCTGCGTCAGGACTTTGATTGTTGGTTCCCAAGAAGATGAAGCAACCTATTTTTGTGTACTATCAGCTTGATCAGTTCTACCAAAACCATCGCCGTTATGTGAAAAGCCGGAATGATGAACAGTACAGGGATCCCTCGGCTAGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014408
ATGAGCTTTTCAGATGGAGCTTCTAAATCGTCTTCCAAGAGTTCGACGAAGCCCACTTATTCTAGGTTTACTCAACAAGAACTTCCTGCCTGCAAACCAATCTTAACTCCTGCATTGGTTATGACAACTTTCATTGTTATTGGCATAGCTTTCATACCGATTGGCCTTTCCCACTTGTCTGCTTCAGAGAAAGTTGTTGAACTCGTGGACCAGTACGACGAGGTCTGCATTCCTGCGGATTCTTCGGATCGTGATGCTGC...

LOC131014408
ATGAAGCAACCTATTTTTGTGTACTATCAGCTTGATCAGTTCTACCAAAACCATCGCCGTTATGTGAAAAGCCGGAATGATGAACAGTACAGGGATCCCTCGGCTAGTGCCCAAACTAGCAGTTGTGAACCAGAAGCACAACTTAGTGAAAACCAGCCTATTGTCCCTTGTGGCCTCATTGCTTGGAGTTTGTTCAACGATACATATACTCTGTCGAGAAATGACATTGCCCTACCAATTAACAAAAAATATATAGCATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798349.1
MSFSDGASKSSSKSSTKPTYSRFTQQELPACKPILTPALVMTTFIVIGIAFIPIGLSHLSASEKVVELVDQYDEVCIPADSSDRDAAYKKRIGYIQDDKTDKTCVRTLIVPKKMKQPIFVYYQLDQFYQNHRRYVKSRNDEQYRDPSASAQTSSCEPEAQLSENQPIVPCGLIAWSLFNDTYTLSRNDIALPINKKYIAWESDRTHKFGDNVYPKNFQNRSLIGGGKLIENIPLNQQEDLLVWMRTAALPNFRKLYGRIE...

XP_057798350.1
MKQPIFVYYQLDQFYQNHRRYVKSRNDEQYRDPSASAQTSSCEPEAQLSENQPIVPCGLIAWSLFNDTYTLSRNDIALPINKKYIAWESDRTHKFGDNVYPKNFQNRSLIGGGKLIENIPLNQQEDLLVWMRTAALPNFRKLYGRIETDLEVNEVIKVVIQNNYNTYSFNGKKKLVISTTTWIGGKNDFLGMVYIIVGGVCLLIALVFIIVYLIKPRPLGDPSYLSWNKNPASVQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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