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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003530`

染色体: Chr03 坐标: 53910690-53912398 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003530`
名称	SmilChr03G003530
描述	uncharacterized SmilChr03G003530
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53910690 - 53912398 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018995`
GeneID	`131018995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018995`
原始查询	`SmilChr03G003530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.8; qcov=0.231; evalue=9.25e-35; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=51; qcov=0.874; evalue=7.7e-141; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803664.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803664.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803664.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803664.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53911067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A11,A23,B103,B128,B136,B18,B36,B37,B74,B75,B88,B9,B90,C17,C18,C41,C60
`Chr3:53911119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B69
`Chr3:53911169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B36,B44,C32,D8
`Chr3:53911175`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A4,B23
`Chr3:53911175`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A4,B23
`Chr3:53911201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B72,C37,C77
`Chr3:53911231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B81,C18,C83
`Chr3:53911234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	81	A1,A14,A16,A24,A25,A6,A7,A9,B1,B104,B112,B117,B121,B122,B125,B128,B129,B133,B135,B14,B140,B17,B18,B2,B21,B26,B31,B32,B36,B38,B40,B41,B43,B47,B49,B5,B56,B6,B70,B72,B74,B76,B77,B87,B9,B93,B95,B96,B98,B99,C10,C15,C20,C25,C26,C29,C3,C30,C37,C38,C46,C48,C5,C50,C51,C56,C58,C62,C67,C69,C76,C77,C79,C81,C82,C84,C87,C9,D1,D3,D6
`Chr3:53911313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B74,C38,C40
`Chr3:53911342`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A19,B46,B49
`Chr3:53911342`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A19,B46,B49
`Chr3:53911347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803664.1

451 aa

226

451

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 174-375 aa PF13359 DDE_Tnp_4 203-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803664.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	2e-16	60.1	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803664.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	174	375	3.8e-105	350.7	Plant transposon protein
`XP_057803664.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	203	366	3.4e-09	37.2	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947681.1
ATGGCATCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGTGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATAATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAAGGAGACGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018995
ATGGCATCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGTGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATAATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAAGGAGACGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803664.1
MASSSNIDASNSSDDEAWEQSVAEHNRQLDRIIEDVVIHAASLSVQPTNHAVRGRRRYIERRREIGHEGVFEQYFSEDPIYPPEYFRTRFRMRKPLFERIMNKLVATDRFFQQHPDAAGRLGMSPIQKCTAAMRVLAYGTSADLHDEYLRMSAQVIRKSVIKFVEGVISNFGAEYLRKPTEEDMAALLHIGERRGFPGMMGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRSGTPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSRNDINVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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